RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
TPI1-201ENST00000229270 PRR14Q9BWN1 585 aa24.39■■□□□ 1.5
TPI1-201ENST00000229270 KCNN2Q9H2S1 579 aa24.39■■□□□ 1.5
TPI1-201ENST00000229270 FRS3O43559 492 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 RAB8AP61006 207 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 BTN3A2P78410 334 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 FZD5Q13467 585 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 TRAM1Q15629 374 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 Q8N402 240 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 KCNJ15Q99712 375 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 MACROD1Q9BQ69 325 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 TMEM43Q9BTV4 400 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 EQTNQ9NQ60 294 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 COMMD3Q9UBI1 195 aa24.39■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 FMO6PO60774 539 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 FAM157BP0CG42 384 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 CD79BP40259 229 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 GAS6Q14393 721 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 ASPGQ86U10 573 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 FAM20CQ8IXL6 584 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 TSTD1Q8NFU3 115 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 OR4E2Q8NGC2 313 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SLC22A18Q96BI1 424 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 OTULINQ96BN8 352 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SERINC2Q96SA4 455 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 WDR45Q9Y484 360 aa24.38■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 TRAPPC13A5PLN9 417 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 FAM25AB3EWG3 89 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 FAM25CB3EWG5 89 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 FAM25GB3EWG6 89 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 TFECO14948 347 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SMIM10L1P0DMW3 83 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 CELP19835 753 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 APEX1P27695 318 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SOX18P35713 384 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SHC2P98077 582 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SHFQ7M4L6 423 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 ACBD7Q8N6N7 88 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SMIM10Q96HG1 83 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 GPR174Q9BXC1 333 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 UBQLN3Q9H347 655 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 A0A1W2PS29 197 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 UNC119BA6NIH7 251 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 ISM1B1AKI9 464 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 FCMRO60667 390 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 PTGER1P34995 402 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 GPR4P46093 362 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 ZNF836Q6ZNA1 936 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 USP53Q70EK8 1073 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 VN1R4Q7Z5H5 301 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 OR7G2Q8NG99 324 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 OR4K14Q8NGD5 310 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 FAM174AQ8TBP5 190 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 KAT2AQ92830 837 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 ORAI3Q9BRQ5 295 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 CHRDQ9H2X0 955 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SRMSQ9H3Y6 488 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 BABAM2Q9NXR7 383 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SATB2Q9UPW6 733 aa24.37■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 A0A1W2PPC4 97 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 BTN3A3O00478 584 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 HPGDSO60760 199 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 ZNF217O75362 1048 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SLC43A1O75387 559 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 STATHP02808 62 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 ZNF136P52737 540 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 CLDN20P56880 219 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 KIR2DS3Q14952 304 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 VASNQ6EMK4 673 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 TRILQ7L0X0 811 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 TMEM255BQ8WV15 326 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 TM4SF19Q96DZ7 209 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 SLX1AQ9BQ83 275 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 TMED9Q9BVK6 235 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 RNF32Q9H0A6 362 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 PIGUQ9H490 435 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 NIPAL2Q9H841 368 aa24.36■■□□□ 1.49
TPI1-201ENST00000229270 KCMF1Q9P0J7 381 aa24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms