RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DhfrP00375 187 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv7-33P01632 114 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtnd2P03893 345 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-T23P06339 357 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sox1P53783 391 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fut4Q11127 433 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtrcQ3SYP2 268 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myl12bQ3THE2 172 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctu2Q3U308 514 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc106Q3ULM0 279 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spag8Q3V0Q6 470 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r117Q7M715 330 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1045Q7TR80 315 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam92aQ8BP22 355 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdc123Q8CII2 336 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 St7lQ8K4P7 559 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bloc1s5Q8R015 185 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med25Q8VCB2 745 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr689Q8VG18 320 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdc42ep1Q91W92 409 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf524Q9D0B1 321 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc69Q9D9Q0 347 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlr1Q9EPQ1 795 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map1bP14873 2464 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Notch4P31695 1964 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv4-86A0A0G2JGE7 114 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Skint2A7XUX6 400 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcea1P10711 301 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxc4Q08624 264 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata13Q5DU57 656 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taar7dQ5QD10 358 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyb5d2Q5SSH8 263 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cst13Q80ZN5 141 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mal2Q8BI08 175 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ExogQ8C163 368 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppwd1Q8CEC6 646 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tab1Q8CF89 502 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gas2l1Q8JZP9 678 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HpgdQ8VCC1 269 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ogfrl1Q8VE52 464 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec2fQ8VI21 196 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr146Q99LE2 333 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myl9Q9CQ19 172 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rprd1bQ9CSU0 326 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Osbpl3Q9DBS9 855 aa11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rtp4Q9ER80 249 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf382B2RXC5 579 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r177E9PXM3 309 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r86L7N213 316 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mc3rP33033 323 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc16a3P57787 470 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r7P59530 312 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps25P62852 125 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdkn2dQ60773 166 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MertkQ60805 994 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbbp4Q60972 425 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc39a9Q8BFU1 308 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc15a3Q8BPX9 578 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw14Q8C2Y5 466 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pqlc3Q8C6U2 202 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EndovQ8C9A2 338 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sdr9c7Q8K3P0 313 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r51Q8VIC6 319 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tram2Q924Z5 370 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phf6Q9D4J7 364 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rsph9Q9D9V4 276 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CalyQ9DCA7 226 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pla2g12aQ9EPR2 192 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PolmQ9JIW4 496 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr179E9PY61 2293 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr396-ps1A0A0U1RNF5 211 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp534A2A7A1 661 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc39aA2ACP1 578 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tyw5A2RSX7 315 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clip3B9EHT4 547 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3149E9PW52 257 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8362K7N6Y6 257 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srsf5O35326 269 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chst3O88199 472 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubl4aP21126 157 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OcmP51879 109 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fabp7P51880 132 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dppa5bP85965 119 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2fbQ3UWQ3 185 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AstlQ6HA09 435 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap22Q8BL80 702 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E330021D16RikQ8BW45 371 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Steap2Q8BWB6 489 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TapbplQ8VD31 451 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr771Q8VFH6 317 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr444Q8VFS6 310 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1052Q8VGR8 312 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asb16Q8VHS5 453 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glyr1Q922P9 546 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LsrQ99KG5 594 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Marveld3Q9D956 376 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf21Q9JJN1 210 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnj10Q9JM63 379 aa11.81□□□□□ -0.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrp4Q8VI56 1905 aa11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.4 ms