RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 TP53INP1Q96A56 240 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 WBP1Q96G27 269 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 RIBC2Q9H4K1 309 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACAD8Q9UKU7 415 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 BLOC1S6Q9UL45 172 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYRFQ9Y2G1 1151 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 MGAQ8IWI9 3026 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR2W5A6NFC9 320 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR10H3O60404 316 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCB7O75027 752 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL33O95760 270 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDAH2O95865 285 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 CT45A8P0DMV1 189 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 CT45A9P0DMV2 189 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCL4P13236 92 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLA2G2AP14555 144 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 FOLR3P41439 243 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 COX10Q12887 443 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 KEAP1Q14145 624 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 CT45A2Q5DJT8 189 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAAH2Q6GMR7 532 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 BCORP1Q8N888 145 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC38A9Q8NBW4 561 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR6T1Q8NGN1 323 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 DHRS1Q96LJ7 313 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 TEX12Q9BXU0 123 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM2Q9C040 744 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC22A11Q9NSA0 550 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 VNN3Q9NY84 501 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 PADI1Q9ULC6 663 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDHR4A6H8M9 788 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 J3KTA2 159 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 TO15178 435 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC16A6O15403 523 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 REM1O75628 298 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 LYNP07948 512 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 COPZ1P61923 177 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 ESRRGP62508 458 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLCXD2Q0VAA5 305 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNAB2Q13303 367 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 EFR3AQ14156 821 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 NCF4Q15080 339 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 THAP5Q7Z6K1 395 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDK20Q8IZL9 346 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC34A3Q8N130 599 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR8K3Q8NH51 312 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC9Q92623 222 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 FEVQ99581 238 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUDT9Q9BW91 350 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 B3GNT4Q9C0J1 378 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 PISDQ9UG56 409 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 HRKO00198 91 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 BCKDKO14874 412 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLD2O14939 933 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYP7B1O75881 506 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZFAND5O76080 213 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 CSTAP01040 98 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 LIMS1P48059 325 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 DAPP51397 102 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUP107P57740 925 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPS15P62841 145 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 FGFBP1Q14512 234 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 EBPQ15125 230 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 EXT1Q16394 746 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 ENTPD8Q5MY95 495 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM205Q6UW68 189 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC3-210ENST00000617904 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms