RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605910.1

TRAM2-AS1-202, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 1,053 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SCDO00767 359 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 STX11O75558 287 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GLSO94925 669 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CBX6O95503 412 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CYP4B1P13584 511 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TBXA2RP21731 343 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EVI2BP34910 448 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DNASE1L1P49184 302 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MAN2A2P49641 1150 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SEC24CP53992 1094 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FOXO1Q12778 655 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FADDQ13158 208 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC10A1Q14973 349 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 COQ5Q5HYK3 327 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DCST2Q5T1A1 773 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TIGD3Q6B0B8 471 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GHDCQ8N2G8 530 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZFP90Q8TF47 636 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RNF138Q8WVD3 245 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CDS1Q92903 461 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GPR137Q96N19 417 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NODALQ96S42 347 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SDF2Q99470 211 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 INPP5KQ9BT40 448 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OR51I1Q9H343 314 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PROK2Q9HC23 129 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC52A3Q9NQ40 469 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SAR1AQ9NR31 198 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DEPPQ9NTK1 212 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CALML5Q9NZT1 146 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GXYLT2A0PJZ3 443 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C9JVG2 144 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CLIC1O00299 241 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FADS1O60427 444 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SNX3O60493 162 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HCN1O60741 890 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UTS2O95399 124 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GSNP06396 782 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OR12D1P0DN82 309 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DRD4P21917 467 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PTPN6P29350 595 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GCKP35557 465 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GNALP38405 381 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CDKN2CP42773 168 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RFX3P48380 749 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TDGF1P3P51864 188 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ATP12AP54707 1039 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KLF10Q13118 480 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MMEL1Q495T6 779 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GFRALQ6UXV0 394 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RNF130Q86XS8 419 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SIAH3Q8IW03 269 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EID3Q8N140 333 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DPP10Q8N608 796 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SH3GL1Q99961 368 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 A0A1B0GVC2 190 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PINLYPA6NC86 204 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms