RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 GIN1Q9NXP7 522 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NTMQ9P121 344 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 STOML1Q9UBI4 398 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 VDAC3Q9Y277 283 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 POLQO75417 2590 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 A6NHS1 94 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ALG1L2C9J202 215 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 H3BNH8 94 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LINC01387J3KSC0 135 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SYT5O00445 386 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SEC14L5O43304 696 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SNX3O60493 162 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SOX30O94993 753 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NUDT14O95848 222 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF708P17019 499 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TBXA2RP21731 343 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OPRM1P35372 400 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MAP3K8P41279 467 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DL3P43628 341 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LHX2P50458 406 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ASCL1P50553 236 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF136P52737 540 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NME5P56597 212 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 HBA1P69905 142 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TFF3Q07654 80 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 BNIP1Q12981 228 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 GANABQ14697 944 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 BCL2A1Q16548 175 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SGCBQ16585 318 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NXNQ6DKJ4 435 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 APOOLQ6UXV4 268 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MISPQ8IVT2 679 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF614Q8N883 585 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF527Q8NB42 609 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ACBD4Q8NC06 268 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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PTPRM-214ENST00000583153 MOAP1Q96BY2 351 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LURAP1Q96LR2 239 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DOCK7Q96N67 2140 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 STACQ99469 402 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SORT1Q99523 831 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP22Q9NRW4 184 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ASIC5Q9NY37 505 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC42Q9Y546 428 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MED12Q93074 2177 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 AKAP9Q99996 3911 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 OR2M5A3KFT3 312 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A20A6NK97 555 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 DUXAA6NLW8 204 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 B4DXG7 233 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 HCRTR2O43614 444 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ATP5HO75947 161 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 RCBTB2O95199 551 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 NPIPA8P0DM63 369 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CAPN3P20807 821 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 MATN1P21941 496 aa7.52□□□□□ -1.21
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