RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 OR3A2P47893 321 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 RAC1P63000 192 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 PHC1P78364 1004 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CUL3Q13618 768 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CCNIQ14094 377 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 POC1BQ8TC44 478 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM110BQ8TC76 370 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CERS2Q96G23 380 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC6A7Q99884 636 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CENPKQ9BS16 269 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CD244Q9BZW8 370 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 MYNNQ9NPC7 610 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 PSAT1Q9Y617 370 aa6.7□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 B4DSR2 109 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CBFA2T2O43439 604 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 EFNA2O43921 213 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 RAD51DO75771 328 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 KRT14P02533 472 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 KRT20P35900 424 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CARD18P57730 90 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 PSG6Q00889 435 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CHRNEQ04844 493 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SCGB2A2Q13296 93 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 RIN1Q13671 783 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 ACAP2Q15057 778 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 TTC27Q6P3X3 843 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SSX8Q7RTT4 187 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM186Q96B77 213 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF145Q96MT1 663 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 PSD2Q9BQI7 771 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 DERL2Q9GZP9 239 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 BCO1Q9HAY6 547 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 GP6Q9HCN6 339 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 C7orf72A4D263 438 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 C9JVG2 144 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 H0YIV9 168 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 PRKD3O94806 890 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 ANGPTL1O95841 491 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 KLK1P06870 262 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 DAOP14920 347 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CD1DP15813 335 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 ENPP1P22413 925 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 MAPK1P28482 360 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SFTPDP35247 375 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC25A3Q00325 362 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 CPTPQ5TA50 214 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-217ENST00000580654 FCRLAQ7L513 359 aa6.68□□□□□ -1.34
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