RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPS6KA2Q15349 733 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPATS1Q496A3 300 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 GGTA1PQ4G0N0 100 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 NHSL2Q5HYW2 709 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CES4AQ5XG92 561 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 FRG2Q64ET8 278 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM81Q6P7N7 255 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ARSKQ6UWY0 536 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 LCA5Q86VQ0 697 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 C4orf33Q8N1A6 199 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 METTL4Q8N3J2 472 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 LIX1Q8N485 282 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 C17orf47Q8NEP4 570 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR7G1Q8NGA0 311 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR4F6Q8NGB9 312 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR4K14Q8NGD5 310 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPPL2AQ8TCT8 520 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRPC4APQ8TEL6 797 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PHF21BQ96EK2 531 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 RILPQ96NA2 401 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 C8orf49Q96NF6 230 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 FRG2BQ96QU4 278 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TIMP4Q99727 224 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 DOHHQ9BU89 302 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ANGPTL4Q9BY76 406 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 VPS11Q9H270 941 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 UBQLN3Q9H347 655 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 EXO5Q9H790 373 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 XPR1Q9UBH6 696 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF639Q9UID6 485 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SCOCQ9UIL1 159 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CES1P1Q9UKY3 287 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 C15orf41Q9Y2V0 281 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 MED12Q93074 2177 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 C1orf226A1L170 272 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERINC4A6NH21 518 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 CD8B2A6NJW9 211 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 HSPB2A8KAH6 182 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 AHRRA9YTQ3 701 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 SYT5O00445 386 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 COPEO14579 308 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 TP53I11O14683 189 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 SMIM24O75264 130 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GLRA3O75311 464 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPAG7O75391 227 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 EPPINO95925 133 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDYNP01213 254 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ATP1B1P05026 303 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GSTA1P08263 222 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPS17P08708 135 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 RBP1P09455 135 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 SBK3P0C264 359 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 CPMP14384 443 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 PORP16435 677 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 NAGAP17050 411 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 NT5EP21589 574 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPX3P22352 226 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ABCD3P28288 659 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 CRHR1P34998 444 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 TIMP3P35625 211 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 PEX19P40855 299 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 CASP3P42574 277 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRPC1P48995 793 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GZMKP49863 264 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ASCL1P50553 236 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDK9P50750 372 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 XKP51811 444 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC16A1P53985 500 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 IST1P53990 364 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GNGT1P63211 74 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPP38P78345 283 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 MGAT2Q10469 447 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 IFT88Q13099 833 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 ODF1Q14990 250 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 HSPB2Q16082 182 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 TIGD3Q6B0B8 471 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC48A1Q6P1K1 146 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM64Q6YI46 380 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 Q6ZSN1 163 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 PAGE2Q7Z2X7 111 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 COMMD6Q7Z4G1 85 aa4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC8-202ENST00000577426 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms