RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 CCL27Q9Y4X3 112 aa21.38■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 ZANQ9Y493 2812 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 SLC28A1O00337 649 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 SCDO00767 359 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 RGS14O43566 566 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 KCNK2O95069 426 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 PLAUP00749 431 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 LCN1P31025 176 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 ATP5J2P56134 94 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 CCDC153Q494R4 210 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 FIGNL1Q6PIW4 674 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 CEP112Q8N8E3 955 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 FBXO30Q8TB52 745 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 NPAS1Q99742 590 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 TMEM204Q9BSN7 226 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 REEP4Q9H6H4 257 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 UBQLN4Q9NRR5 601 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 SH3BP4Q9P0V3 963 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 NTMQ9P121 344 aa21.37■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 A0A0J9YW62 118 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 NPIPB8E9PQR5 432 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 TBX19O60806 448 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 PROCP04070 461 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 ACP2P11117 423 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 SERPINB4P48594 390 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 CLEC6AQ6EIG7 209 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 TRABD2AQ86V40 505 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 SLC16A11Q8NCK7 471 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 FAM110BQ8TC76 370 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 GIMAP5Q96F15 307 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 CCT7Q99832 543 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 TXLNGYQ9BZA5 131 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 C12orf49Q9H741 205 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 PRR14LQ5THK1 2151 aa21.36■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 AKAP10O43572 662 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 HSPA4LO95757 839 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 ALOX5P09917 674 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 AGTR1P30556 359 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 EIF1P41567 113 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 CCT5P48643 541 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 CARD18P57730 90 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 DUSP5Q16690 384 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 MFSD12Q6NUT3 480 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 LILRA2Q8N149 483 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 COX18Q8N8Q8 333 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 CCDC63Q8NA47 563 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 STEAP2Q8NFT2 490 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 OSTF1Q92882 214 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 KLHL15Q96M94 604 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 MDFIQ99750 246 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 TIGARQ9NQ88 270 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 OXSMQ9NWU1 459 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 LAMP3Q9UQV4 416 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa21.35■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 A0A1W2PQD3 144 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 PLIN3O60664 434 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 SDC1P18827 310 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 FRKP42685 505 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 ZNF385BQ569K4 471 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 TMEM201Q5SNT2 666 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 ALKBH2Q6NS38 261 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 ZAR1Q86SH2 424 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 KIF18AQ8NI77 898 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 POC1BQ8TC44 478 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 JADE3Q92613 823 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 TSSK3Q96PN8 268 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 HDHD5Q9BXW7 423 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 DNHD1Q96M86 4753 aa21.34■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 NEFHP12036 1026 aa21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 CPA3P15088 417 aa21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 PRIM2P49643 509 aa21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 PDE7AQ13946 482 aa21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 ROBO4Q8WZ75 1007 aa21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 S100PBPQ96BU1 408 aa21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 C16orf58Q96GQ5 468 aa21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 FCRL1Q96LA6 429 aa21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 NGBQ9NPG2 151 aa21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 FBXO34Q9NWN3 711 aa21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 SNX8Q9Y5X2 465 aa21.33■■□□□ 1.01
PBX1-217ENST00000559578 CHEK2O96017 543 aa21.32■■□□□ 1
PBX1-217ENST00000559578 LINGO3P0C6S8 592 aa21.32■■□□□ 1
PBX1-217ENST00000559578 DDX5P17844 614 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PBX1-217ENST00000559578 ELK4P28324 431 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms