RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PANX1	Q96RD7	426 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	TRIB1	Q96RU8	372 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	INPP5K	Q9BT40	448 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	RMND5A	Q9H871	391 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PP18	115 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	FRG2C	A6NGY1	282 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	TTC36	A6NLP5	189 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	RNF223	E7ERA6	249 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	RFXANK	O14593	260 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	T	O15178	435 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC22A2	O15244	555 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ACOX3	O15254	700 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CCDC22	O60826	627 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	BMP7	P18075	431 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	UQCRC2	P22695	453 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SOAT1	P35610	550 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CDKN2C	P42773	168 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PTH2R	P49190	550 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CORO7	P57737	925 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	KLF10	Q13118	480 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	OPN5	Q6U736	354 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	LYPD8	Q6UX82	237 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SZRD1	Q7Z422	152 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	KIF18B	Q86Y91	864 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	TAGAP	Q8N103	731 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ITCH	Q96J02	903 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	TIMP4	Q99727	224 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	EQTN	Q9NQ60	294 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	JKAMP	Q9P055	326 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		12.51	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SNPH	O15079	494 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	HCN1	O60741	890 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	FBXO45	P0C2W1	286 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PTPN6	P29350	595 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PSG6	Q00889	435 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GAB1	Q13480	694 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	TP53BP2	Q13625	1128 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	NNAT	Q16517	81 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ACKR1	Q16570	336 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SAXO2	Q658L1	398 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PIGT	Q969N2	578 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	NEURL3	Q96EH8	262 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	LRRC46	Q96FV0	321 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	DACH2	Q96NX9	599 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PIP5K1A	Q99755	562 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222		A0A096LPI6	279 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	NKX2-2	O95096	273 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	IL2RA	P01589	272 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222		P04436	131 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CS-231	ENST00000552222	GSN	P06396	782 aa		12.49	□□□□□ -0.41

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