RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	APOO	Q9BUR5	198 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	PORCN	Q9H237	461 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	MED20	Q9H944	212 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308		Q9HAA7	133 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	NMUR1	Q9HB89	426 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	ASB3	Q9Y575	518 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	FKBP7	Q9Y680	259 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIO	O75962	3097 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	CDH23	Q9H251	3354 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	GAK	O14976	1311 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	MYH1	P12882	1939 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC26	A0AVF1	554 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC30	A6NM36	301 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FBP2	O00757	339 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CYB561D2	O14569	222 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CFLAR	O15519	480 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF749	O43361	778 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC159	P0C7I6	412 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GSTT2	P0CG29	244 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GSTT2B	P0CG30	244 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CD1D	P15813	335 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKACG	P22612	351 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PGF	P49763	221 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RGS4	P49798	205 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NDST2	P52849	883 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NAPA	P54920	295 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF876P	Q49A33	203 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PNCK	Q6P2M8	343 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LEG1	Q6P5S2	330 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ATRAID	Q6UW56	229 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CARM1	Q86X55	608 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	C12orf42	Q96LP6	360 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RCHY1	Q96PM5	261 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	USP28	Q96RU2	1077 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	IWS1	Q96ST2	819 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ALG12	Q9BV10	488 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR41	Q9HAD4	459 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TBX21	Q9UL17	535 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MYO10	Q9HD67	2058 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	USP34	Q70CQ2	3546 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MYH8	P13535	1937 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A087WYN8	130 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308		A8MUI8	341 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MPTX1	A8MV57	137 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	JAK2	O60674	1132 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SDC3	O75056	442 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PALM	O75781	387 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA0754	O94854	1291 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CSF2	P04141	144 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UGT2B4	P06133	528 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ASGR1	P07306	291 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GSTA1	P08263	222 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	BTD	P43251	543 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	HAND2	P61296	217 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ERVK-16	P61578	105 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RIPK1	Q13546	671 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TFDP1	Q14186	410 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SELPLG	Q14242	412 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CAMK4	Q16566	473 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UPP1	Q16831	310 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ECSCR	Q19T08	205 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87

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