RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	PPM1A	P35813	382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OR2L5	Q8NG80	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OR2L3	Q8NG85	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RBP7	Q96R05	134 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PIGU	Q9H490	435 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PHF11	Q9UIL8	331 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RGS5	O15539	181 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FRS3	O43559	492 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TF	P02787	698 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CEACAM5	P06731	702 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	UCHL1	P09936	223 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CD8B	P10966	210 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PRG2	P13727	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	DRD5	P21918	477 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CALCR	P30988	508 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	MC3R	P41968	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CDH11	P55287	796 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	QPRT	Q15274	297 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FCN2	Q15485	313 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	GJD3	Q8N144	294 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SCN2A	Q99250	2005 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PIN1P1	O15428	100 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FABP7	O15540	132 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ICMT	O60725	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CRYZL1	O95825	349 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	LRG1	P02750	347 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RAF1	P04049	648 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ADH5	P11766	374 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	S1PR1	P21453	382 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NT5E	P21589	574 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	DPP4	P27487	766 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SHC1	P29353	583 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ADAM15	Q13444	863 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF234	Q14588	700 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	LTB4R	Q15722	352 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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