RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532032.5

ATXN3-215, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATXN3, Length 1,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-215	ENST00000532032	LIF	P15018	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NFKBIA	P25963	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CD40LG	P29965	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CASP2	P42575	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MAP2K4	P45985	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	DIO1	P49895	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MC1R	Q01726	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	KEAP1	Q14145	624 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	GALNT3	Q14435	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NPTX1	Q15818	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SBSN	Q6UWP8	590 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	STARD8	Q92502	1023 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	FIG4	Q92562	907 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PITX2	Q99697	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	P2RY12	Q9H244	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	RMND5A	Q9H871	391 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	EXD2	Q9NVH0	621 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032		A0A0D9SEW6	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MANBA	O00462	879 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	AREL1	O15033	823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PFDN6	O15212	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TAPBP	O15533	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	OR1I1	O60431	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	RAD1	O60671	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	VPS26A	O75436	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NDUFS3	O75489	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	WDR47	O94967	919 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	CST1	P01037	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	IL6	P05231	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF24	P17028	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PRKACG	P22612	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	GNLY	P22749	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	UGT2B10	P36537	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	RGR	P47804	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SERPINB10	P48595	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	DAP	P51397	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	PPP5C	P53041	499 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	NCS1	P62166	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	RAB1A	P62820	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	RAPSN	Q13702	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATXN3-215	ENST00000532032	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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