RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519211.5

CNOT8-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

TSL 3

Gene CNOT8, Length 620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-208ENST00000519211 TMEM19Q96HH6 336 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 RUBCNLQ9H714 662 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.52□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 A0A087WZY1 265 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 C5orf58C9J3I9 102 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 LINC01387J3KSC0 135 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 J3QKU1 62 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 DNAJA2O60884 412 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 THBS1P07996 1170 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 SLC6A2P23975 617 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 GZMMP51124 257 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 MNAT1P51948 309 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 MTPNP58546 118 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 CDK6Q00534 326 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ART3Q13508 389 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 IGFBP7Q16270 282 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 PEX5LQ8IYB4 626 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 C10orf111Q8N326 155 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 LAT2Q9GZY6 243 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 DSN1Q9H410 356 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 IFT52Q9Y366 437 aa14.51□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 C7orf72A4D263 438 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 B4DXG7 233 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 AIM2O14862 343 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ZNF264O43296 627 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 TRAPPC6AO75865 159 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 WISP2O76076 250 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 PGM3O95394 542 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 CELA3AP09093 270 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 NPIPA8P0DM63 369 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 UBL4AP11441 157 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 NID1P14543 1247 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 DPP4P27487 766 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 GCKP35557 465 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 P2RX1P51575 399 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 KCNJ10P78508 379 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 SELPLGQ14242 412 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 MAPK14Q16539 360 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 KRT73Q86Y46 540 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 PTOV1Q86YD1 416 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 FITM2Q8N6M3 262 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 HIPK4Q8NE63 616 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 SARAFQ96BY9 339 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ZG16BQ96DA0 208 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ARSGQ96EG1 525 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ECSITQ9BQ95 431 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 LDAHQ9H6V9 325 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 MED11Q9P086 117 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 BCKDKO14874 412 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 HCRTR2O43614 444 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ZIC3O60481 467 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ACTL6AO96019 429 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 CSTAP01040 98 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 IL7RP16871 459 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 CHMP24386 653 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 PGM1P36871 562 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 NUDT2P50583 147 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 ZNF117Q03924 483 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 SKP2Q13309 424 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 SCARB2Q14108 478 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 VEZF1Q14119 521 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 CYP51A1Q16850 503 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 LIN52Q52LA3 116 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 RABL3Q5HYI8 236 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 RNF220Q5VTB9 566 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT8-208ENST00000519211 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms