RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRAF2O60831 178 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 RAMP1O60894 148 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADCY5O95622 1261 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCNE2O96020 404 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CHTF8P0CG12 524 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 OMGP23515 440 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 DCKP27707 260 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CALCRP30988 508 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC26A3P40879 764 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 TAS2R19P59542 299 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 HAND2P61296 217 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ESRRGP62508 458 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPS6P62753 249 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 RBX1P62877 108 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SYCNQ0VAF6 134 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 BNIP1Q12981 228 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 MEA1Q16626 185 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 C1orf146Q5VVC0 180 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZFAND6Q6FIF0 208 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 FRMPD2BQ6IN97 320 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRR5LQ6MZQ0 368 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 LY6G5BQ8NDX9 201 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR9A2Q8NGT5 310 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 MCOLN3Q8TDD5 553 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 C7orf26Q96N11 449 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 CSPG4P5Q96PW8 444 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 S1PR3Q99500 378 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 SSX3Q99909 188 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 MIS18AQ9NYP9 233 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR1A2Q9Y585 309 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 PFASO15067 1338 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 SYT7O43581 403 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 ACSL4O60488 711 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 SUPT3HO75486 399 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 SCRG1O75711 98 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPP1P10451 314 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCNA2P20248 432 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 SAT1P21673 171 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPC3P51654 580 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 RBPJQ06330 500 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 TPBGQ13641 420 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 TEX44Q53QW1 395 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 LRRC73Q5JTD7 316 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 BTNL8Q6UX41 500 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM136Q6ZRR5 245 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM92BQ6ZTR7 304 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 CAMKMTQ7Z624 323 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC00518Q8N0U6 118 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 LGI3Q8N145 548 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC191Q8NCU4 936 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR10G9Q8NGN4 311 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 DTX3LQ8TDB6 740 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 HGDQ93099 445 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPSB1Q96BD6 273 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMCO6Q96DC7 493 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 LRRC2Q9BYS8 371 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 CXXC4Q9H2H0 198 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 TM9SF3Q9HD45 589 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 HMG20AQ9NP66 347 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 GIMAP4Q9NUV9 329 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 TAGLN3Q9UI15 199 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 KCNK6Q9Y257 313 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 SIGLEC7Q9Y286 467 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 DHRS7Q9Y394 339 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 SH3PXD2BA1X283 911 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 C19orf71A6NCJ1 209 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 NPIPA2E9PIF3 369 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 SGK1O00141 431 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 BUB1O43683 1085 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 TNFSF13O75888 250 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 PGLSO95336 258 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 LCA5LO95447 670 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 BTCP35070 178 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 STARP49675 285 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 EMP2P54851 167 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 LIM2P55344 173 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 HMGCS1Q01581 520 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC3A1Q07837 685 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCLAFQ15004 111 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 C6orf163Q5TEZ5 329 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 RAET1GQ6H3X3 334 aa-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms