RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513524.5

GPBP1-206, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, human

TSL 5

Gene GPBP1, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPBP1-206	ENST00000513524	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	LRRC43	Q8N309	656 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	M1AP	Q8TC57	530 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	RIT2	Q99578	217 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	KDR	P35968	1356 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	RIPK2	O43353	540 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	LAMP1	P11279	417 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	FOLR2	P14207	255 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	CPN1	P15169	458 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	TBXA2R	P21731	343 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	UQCRC2	P22695	453 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	MAGEA9	P43362	315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	FNTA	P49354	379 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	RND3	P61587	244 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SYPL1	Q16563	259 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524		A0A1W2PNV4	684 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524		A8MX80	341 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC17A2	O00624	439 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC2A10	O95528	541 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	IGHD	P01880	384 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	PGAM2	P15259	253 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	PGC	P20142	388 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	TPSB2	P20231	275 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	HNF1A	P20823	631 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74	5e-9	■□□□□ 9.3
GPBP1-206	ENST00000513524	NF2	P35240	595 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF154	Q13106	437 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	CHIT1	Q13231	466 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	RUNX3	Q13761	415 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	MESD	Q14696	234 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	CCT7	Q99832	543 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	VCX2	Q9H322	139 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	PTCH1	Q13635	1447 aa		4.15	□□□□□ -1.74
GPBP1-206	ENST00000513524	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524		E9PLD3	99 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	GPRIN2	O60269	458 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	NOL4	O94818	638 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	LRAT	O95237	230 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	HPCAL1	P37235	193 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	AP3M2	P53677	418 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	VLDLR	P98155	873 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	PAX2	Q02962	417 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	SERTAD2	Q14140	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	NDUFA9	Q16795	377 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GPBP1-206	ENST00000513524	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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