RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512855.5

FAM200B-218, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM200B, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-218ENST00000512855 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 ZIM2Q9NZV7 527 aa20.54■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.54■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 PKDREJQ9NTG1 2253 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 DOCK7Q96N67 2140 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 NPIPA7E9PJI5 369 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 GMFGO60234 142 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 SLC22A3O75751 556 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 IL6P05231 212 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 NPIPA8P0DM63 369 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 DYDC1Q8WWB3 177 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 INPP5KQ9BT40 448 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 CLCF1Q9UBD9 225 aa20.53■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 A0A087WZY1 265 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 CLCA1A8K7I4 914 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 HCRTR2O43614 444 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 AGR2O95994 175 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 CDKN2CP42773 168 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF136P52737 540 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 CASP9P55211 416 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 CLDN15P56746 228 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 MCEMP1Q8IX19 187 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 C9orf106Q8NAJ2 232 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 OR5M1Q8NGP8 315 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 WNT2BQ93097 391 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 PANX1Q96RD7 426 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 KLHDC3Q9BQ90 382 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 TRIM8Q9BZR9 551 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 EXD2Q9NVH0 621 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 VDAC3Q9Y277 283 aa20.52■□□□□ 0.88
FAM200B-218ENST00000512855 C7orf72A4D263 438 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC154A6NI56 674 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 DVL2O14641 736 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 FCMRO60667 390 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 C1QCP02747 245 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 GUSBP08236 651 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF17P17021 662 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 IDH3AP50213 366 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 TM9SF2Q99805 663 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF350Q9GZX5 532 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 DTNAQ9Y4J8 743 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 ITPR2Q14571 2701 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 STX11O75558 287 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 OR12D1P0DN82 309 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 CTSSP25774 331 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF117Q03924 483 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF141Q15928 474 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 PLPPR5Q32ZL2 321 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 C16orf62Q7Z3J2 963 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 MIER2Q8N344 545 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 MEIOBQ8N635 442 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 RAB8BQ92930 207 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 ZBTB8AQ96BR9 441 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 MAGEB18Q96M61 343 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 ZFP3Q96NJ6 502 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 NPAS1Q99742 590 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 EBF4Q9BQW3 602 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 TCF7L2Q9NQB0 619 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 MED17Q9NVC6 651 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 KCNE5Q9UJ90 142 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 ICAM5Q9UMF0 924 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 SHISA8B8ZZ34 492 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 H3BML4 177 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 H3BNH8 94 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 OIP5O43482 229 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 RCBTB2O95199 551 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 BMP5P22003 454 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 KHKP50053 298 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 CLDN20P56880 219 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM200B-218ENST00000512855 FUT5Q11128 374 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms