RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507692.5

SNHG4-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 5

Gene SNHG4, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-205	ENST00000507692	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	NEURL3	Q96EH8	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ITCH	Q96J02	903 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	SDF2	Q99470	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	OR51I1	Q9H343	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	MED11	Q9P086	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	FBN2	P35556	2912 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692		A0A087WZY1	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692		B4DXG7	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692		H3BML4	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	HMGN4	O00479	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF264	O43296	627 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	GMFG	O60234	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ZIC3	O60481	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	NUDT14	O95848	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	EPPIN	O95925	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	GSN	P06396	782 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	GUSB	P08236	651 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF708	P17019	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF17	P17021	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	COL8A1	P27658	744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	TIMP3	P35625	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	CDKN2C	P42773	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	MAGEA8	P43361	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	LHX2	P50458	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ATP4B	P51164	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	P2RX1	P51575	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	CASP9	P55211	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	CLDN18	P56856	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	HPCA	P84074	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	SRY	Q05066	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	SQLE	Q14534	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	GPR68	Q15743	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	HSPB2	Q16082	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	DCST1	Q5T197	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG4-205	ENST00000507692	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms