RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCD5Q86SK9 330 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 MON1AQ86VX9 555 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPRA1Q86W33 373 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC39A7Q92504 469 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 EDEM1Q92611 657 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAL2Q969L2 176 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF382Q96SR6 550 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 PKP4Q99569 1192 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR21Q99679 349 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 NME7Q9Y5B8 376 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR7A17O14581 309 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRAF2O60831 178 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXB5P09067 269 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAC2P15153 192 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPA2P15927 270 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 MGMTP16455 207 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXA5P20719 270 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBXA2RP21731 343 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 RGS19P49795 217 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR10A3P58181 314 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 SP4Q02446 784 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITKQ08881 620 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 RSU1Q15404 277 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF626Q68DY1 528 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 DEFB106AQ8N104 65 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 THEM6Q8WUY1 208 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ISOC2Q96AB3 205 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 RGMAQ96B86 450 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 MED8Q96G25 268 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALG8Q9BVK2 526 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFT27Q9BW83 186 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 TREM1Q9NP99 234 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 TDP1Q9NUW8 608 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 RHCGQ9UBD6 479 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPT2Q9UMR5 302 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 RASD1Q9Y272 281 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 M0QZ92 97 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 SULT2B1O00204 365 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLIC1O00299 241 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 IMPA2O14732 288 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFNA2P01563 188 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADH1AP07327 375 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRSS56P0CW18 603 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 CPT2P23786 658 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 MSX1P28360 303 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAP3K8P41279 467 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIR3DL2P43630 455 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 DAOAP59103 153 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZXDBP98169 803 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 SORDQ00796 357 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 MPPED2Q15777 294 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 CSRP2Q16527 193 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 XKR3Q5GH77 459 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 DPPA4Q7L190 304 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACOT1Q86TX2 421 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 GINS4Q9BRT9 223 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR51B6Q9H340 312 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 NOX3Q9HBY0 568 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACER3Q9NUN7 267 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 CBLCQ9ULV8 474 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1W2PPH5 198 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 EMC8O43402 210 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLK8O60259 260 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 SC5DO75845 299 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC25A27O95847 323 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 MT-ND4LP03901 98 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 STAG3L1P0CL83 205 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-210ENST00000490478 HTR2AP28223 471 aa6.44□□□□□ -1.38
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