RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490404.5

PFKFB4-214, Transcript of 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-biphosphatase 4, humanhuman

TSL 3

Gene PFKFB4, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4-214ENST00000490404 CD47Q08722 323 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 TSPAN31Q12999 210 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 RAPSNQ13702 412 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 EFR3AQ14156 821 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 NPTX1Q15818 432 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 PODNL1Q6PEZ8 512 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 ZNF773Q6PK81 442 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CASP12Q6UXS9 341 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 HSDL2Q6YN16 418 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 LACC1Q8IV20 430 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 MISPQ8IVT2 679 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CLIP4Q8N3C7 705 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 SVOPQ8N4V2 548 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 BMPERQ8N8U9 685 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 NUBPLQ8TB37 319 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 TEX47Q8TBZ9 253 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 ZG16BQ96DA0 208 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 FAM122AQ96E09 287 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 FUZQ9BT04 418 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 ULBP3Q9BZM4 244 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 NINQ8N4C6 2090 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CEP250Q9BV73 2442 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 A0A1W2PQD3 144 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 DPPA5A6NC42 116 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 SERINC4A6NH21 518 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 ZAR1LA6NP61 321 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 A8MUA0 341 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 E9PQ18 207 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 SLC1A7O00341 560 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 PEX12O00623 359 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CHP2O43745 196 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 REM1O75628 298 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CLIC3O95833 236 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 GASTP01350 101 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 SMIM18P0DKX4 95 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CYP4B1P13584 511 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 ATP6V1B1P15313 513 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 NAGAP17050 411 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 TBXA2RP21731 343 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CRHBPP24387 322 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 FPR3P25089 353 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 GPR143P51810 404 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 ZNF136P52737 540 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 SMSP52788 366 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CDK5R2Q13319 367 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 BORAQ6PGQ7 559 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 ULK3Q6PHR2 472 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 LSMEM1Q8N8F7 131 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 FAM81AQ8TBF8 368 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 DOK4Q8TEW6 326 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 OSTF1Q92882 214 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 TCEAL3Q969E4 200 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 MYDGFQ969H8 173 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 ADIPOR1Q96A54 375 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 SLC38A2Q96QD8 506 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CTRCQ99895 268 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 DDA1Q9BW61 102 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 NDEL1Q9GZM8 345 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 CLN6Q9NWW5 311 aa9.12□□□□□ -0.95
PFKFB4-214ENST00000490404 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms