RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482558.5

SNX13-208, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 1,139 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-208ENST00000482558 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 A0A0G2JPF8 293 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 GSAPA4D1B5 854 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 GAGE10A6NGK3 116 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 LRRC72A6NJI9 287 aa7.19□□□□□ -1.26
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SNX13-208ENST00000482558 CLDN24A6NM45 220 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 TBC1D3LB9A6J9 549 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 J3KTA2 159 aa7.19□□□□□ -1.26
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SNX13-208ENST00000482558 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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SNX13-208ENST00000482558 SCAMP1O15126 338 aa7.19□□□□□ -1.26
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SNX13-208ENST00000482558 SH3BGRLO75368 114 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 KLHL18O94889 574 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 GADD45GO95257 159 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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SNX13-208ENST00000482558 GRPP07492 148 aa7.19□□□□□ -1.26
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SNX13-208ENST00000482558 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 ACP5P13686 325 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 IL7RP16871 459 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 ZNF12P17014 697 aa7.19□□□□□ -1.26
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SNX13-208ENST00000482558 PCSK6P29122 969 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 MPIP34949 423 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 IFNGR2P38484 337 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 LIMS1P48059 325 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 PLA2G16P53816 162 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 CRISP3P54108 245 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 ADPRHP54922 357 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 HPCAP84074 193 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 TP53BP2Q13625 1128 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 ATP1A4Q13733 1029 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 KIR2DS3Q14952 304 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 RPE65Q16518 533 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 EOGTQ5NDL2 527 aa7.19□□□□□ -1.26
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SNX13-208ENST00000482558 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.19□□□□□ -1.26
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SNX13-208ENST00000482558 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.19□□□□□ -1.26
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SNX13-208ENST00000482558 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 LGI4Q8N135 537 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 ZNF740Q8NDX6 193 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 HMGB4Q8WW32 186 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 MAL2Q969L2 176 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 PERPQ96FX8 193 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 WDR92Q96MX6 357 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 BBS4Q96RK4 519 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 MYADMQ96S97 322 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 FEVQ99581 238 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 KXD1Q9BQD3 176 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 LHPPQ9H008 270 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 BCO1Q9HAY6 547 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 TMEM140Q9NV12 185 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 VNN3Q9NY84 501 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 IL19Q9UHD0 177 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 RAB23Q9ULC3 237 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-208ENST00000482558 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.19□□□□□ -1.26
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