RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 CYB5R4Q7L1T6 521 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 NAXDQ8IW45 347 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF683Q8IZ20 524 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 NUP43Q8NFH3 380 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 OR10S1Q8NGN2 331 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 FAR1Q8WVX9 515 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM45BQ96B21 275 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 NXNL1Q96CM4 212 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 FOPNLQ96NB1 174 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 SERPINB11Q96P15 392 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 OR14A2Q96R54 314 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 RNF2Q99496 336 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 CPNE1Q99829 537 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 MECRQ9BV79 373 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM109Q9BVC6 243 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 WDR41Q9HAD4 459 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 GCM1Q9NP62 436 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 FZD3Q9NPG1 666 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 OR52A1Q9UKL2 312 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 ZDHHC9Q9Y397 364 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 OR10H1Q9Y4A9 318 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 PSME4Q14997 1843 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-208ENST00000474246 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A1W2PQY0 241 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 C7orf72A4D263 438 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 OR2W5A6NFC9 320 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 NEMP2A6NFY4 417 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PP2D1A8MPX8 630 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM25AB3EWG3 89 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM25CB3EWG5 89 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM25GB3EWG6 89 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 E5RJQ4 531 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SCDO00767 359 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 RAB29O14966 203 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ADAM12O43184 909 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 TM7SF2O76062 418 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SERPINA1P01009 418 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 TCRBP04435 133 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ARSAP15289 507 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 AMD1P17707 334 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CR2P20023 1033 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 GABRA4P48169 554 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 AKR1D1P51857 326 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ART1P52961 327 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CDH13P55290 713 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 VLDLRP98155 873 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 E2F1Q01094 437 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC6A3Q01959 620 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 MBTD1Q05BQ5 628 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 BNIP2Q12982 314 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 TAF13Q15543 124 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CARTPTQ16568 116 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 UGCGQ16739 394 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 HAGHQ16775 308 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 TATDN3Q17R31 274 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 MANEALQ5VSG8 457 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM107Q6UX40 140 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC16A9Q7RTY1 509 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 APCDD1Q8J025 514 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PARP8Q8N3A8 854 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 OR51A7Q8NH64 312 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 NUBPLQ8TB37 319 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 M1APQ8TC57 530 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF398Q8TD17 642 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 NAT14Q8WUY8 206 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CDS1Q92903 461 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 L3HYPDHQ96EM0 354 aa5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
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