RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 GCGRP47871 477 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS7P62081 194 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 SIGLEC14Q08ET2 396 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF273Q14593 569 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 OPCMLQ14982 345 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF311Q5JNZ3 666 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM255AQ5JRV8 349 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TCTE1Q5JU00 501 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 FGD2Q7Z6J4 655 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 UXS1Q8NBZ7 420 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 SFXN2Q96NB2 322 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 SEC22CQ9BRL7 303 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 OR10A4Q9H209 315 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ASF1AQ9Y294 204 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 DAPL1A0PJW8 107 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 H7BY64 318 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 GMDSO60547 372 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 LATS1O95835 1130 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ADRB1P08588 477 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TIMP2P16035 220 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 UGT2B7P16662 529 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 VEGFCP49767 419 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 CLDN2P57739 230 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA1024LP59773 190 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ALKAL2Q6UX46 152 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TFAP2EQ6VUC0 442 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM25Q86YD3 366 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ACBD7Q8N6N7 88 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 COQ8AQ8NI60 647 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 PRAP1Q96NZ9 151 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 C20orf85Q9H1P6 137 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 COPZ2Q9P299 210 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA0355O15063 1070 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 CXCL2P19875 107 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 METAP1P53582 386 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 SHC2P98077 582 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 DUSP2Q05923 314 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAM2Q15035 370 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF697Q5TEC3 545 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 FAAP20Q6NZ36 180 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 CMIPQ8IY22 773 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 AMDHD1Q96NU7 426 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ENKD1Q9H0I2 346 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 IL21Q9HBE4 155 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 BRD7Q9NPI1 651 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 CA10Q9NS85 328 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 MED9Q9NWA0 146 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 AHSPQ9NZD4 102 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC13A4Q9UKG4 626 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TRABD2BA6NFA1 517 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 J3QLW9 94 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 THY1P04216 161 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 CTSLP07711 333 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ELFN1P0C7U0 828 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF19P17023 458 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ATF1P18846 271 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 CDC73Q6P1J9 531 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 GAREM2Q75VX8 874 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM129CQ86XR2 697 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 KRT78Q8N1N4 520 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 MOSPD2Q8NHP6 518 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 DIO2Q92813 273 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TIFAQ96CG3 184 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ORAI1Q96D31 301 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 MS4A8Q9BY19 250 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM168Q9H0V1 697 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 OR51V1Q9H2C8 321 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 MARK1Q9P0L2 795 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 POMT2Q9UKY4 750 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 TFP02787 698 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 CLUP10909 449 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR68Q15743 365 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF620Q6ZNG0 422 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 OVCH2Q7RTZ1 564 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ADCK2Q7Z695 626 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 NPAS4Q8IUM7 802 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC116Q8IYX3 515 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 STPG2Q8N412 459 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 VN1R2Q8NFZ6 395 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ABHD4Q8TB40 342 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 GANCQ8TET4 914 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 OSTF1Q92882 214 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms