RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2M5A3KFT3 312 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC36A6NLP5 189 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 AHRRA9YTQ3 701 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 DIAPH2O60879 1101 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR1O75083 606 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TGM6O95932 706 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PGRP06401 933 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CPN1P15169 458 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 IGFBP2P18065 325 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 UQCRC2P22695 453 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SHC1P29353 583 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 S100A3P33764 101 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SMSP52788 366 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MVDP53602 400 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN20P56880 219 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP10-9P60411 292 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXF2Q12947 444 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SYPL1Q16563 259 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CGB2Q6NT52 195 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MTFR2Q6P444 385 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf111Q8N326 155 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 NATD1Q8N6N6 113 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 COX18Q8N8Q8 333 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS33AQ96AX1 596 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 C7orf26Q96N11 449 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC115Q96NT0 180 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIB1Q96RU8 372 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MKLN1Q9UL63 735 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 VDAC3Q9Y277 283 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 LRBAP50851 2863 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PQD3 144 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC154A6NI56 674 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CD8B2A6NJW9 211 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN24A6NM45 220 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CLCA1A8K7I4 914 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 HMGN4O00479 90 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 UBDO15205 165 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFB5O43674 189 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM11O75078 769 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF21O75509 655 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A3O75751 556 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT2B17O75795 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTL6AO96019 429 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 NGFRP08138 427 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CHRM4P08173 479 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 GABRA1P14867 456 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF708P17019 499 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CHMP24386 653 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CHRNB4P30926 498 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP12AP54707 1039 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 CHRNEQ04844 493 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR68Q15743 365 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 GSTA3Q16772 222 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 GGNQ86UU5 652 aa6.32□□□□□ -1.4
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