RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SHQ1-202ENST00000444040 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.85□□□□□ -0.03
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SHQ1-202ENST00000444040 MED20Q9H944 212 aa14.85□□□□□ -0.03
SHQ1-202ENST00000444040 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SHQ1-202ENST00000444040 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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