RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442971.1

SSXP3-201, Transcript of SSX family pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SSXP3, Length 1,300 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSXP3-201ENST00000442971 CCDC162PA2VCL2 907 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 M0R233 179 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 CDC14BO60729 498 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 RAMP3O60896 148 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 NCR1O76036 304 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PF4V1P10720 104 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 SSTR4P31391 388 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ADRA1AP35348 466 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 WASHC5Q12768 1159 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 HFEQ30201 348 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 CLEC6AQ6EIG7 209 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 KLHL10Q6JEL2 608 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 NPNTQ6UXI9 565 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PID1Q7Z2X4 250 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PLD5Q8N7P1 536 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 KCTD6Q8NC69 237 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 C17orf47Q8NEP4 570 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 NUP37Q8NFH4 326 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 OR2M3Q8NG83 312 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 OR4F15Q8NGB8 312 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 STYXQ8WUJ0 223 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 TMCO6Q96DC7 493 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PRR25Q96S07 402 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 HAUS8Q9BT25 410 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 MYLK2Q9H1R3 596 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 UBAP1Q9NZ09 502 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 A0A0J9YW62 118 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 BICDL2A1A5D9 508 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 TRIM49D1C9J1S8 452 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 GMFGO60234 142 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 NPPBP16860 134 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 SYT1P21579 422 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 CERS1P27544 350 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ATP5DP30049 168 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 GEMP55040 296 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 CARD18P57730 90 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PLCXD2Q0VAA5 305 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 BIKQ13323 160 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 KCNJ11Q14654 390 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 NNATQ16517 81 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 LGSNQ5TDP6 509 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 USP51Q70EK9 711 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ZNF100Q8IYN0 542 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 UBE2J2Q8N2K1 259 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 OR8K1Q8NGG5 319 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 OR52K1Q8NGK4 314 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 NELFBQ8WX92 580 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 RAB1CQ92928 201 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 RIT1Q92963 219 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 C16orf58Q96GQ5 468 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 OLFM3Q96PB7 478 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PSD2Q9BQI7 771 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 RHOXF2Q9BQY4 288 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 DPAGT1Q9H3H5 408 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 SLC17A5Q9NRA2 495 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 SLC7A10Q9NS82 523 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 MED11Q9P086 117 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5.99□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 CLDN25C9JDP6 229 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 IGHV3-9P01782 118 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 QDPRP09417 244 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 CMA1P23946 247 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 HGFACQ04756 655 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 CDH17Q12864 832 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PNOCQ13519 176 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 SLMAPQ14BN4 828 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 PDK2Q15119 407 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 TMEM44Q2T9K0 475 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 FCRLAQ7L513 359 aa5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SSXP3-201ENST00000442971 ZNF567Q8N184 647 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms