RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440288.6

SH3BGR-206, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

TSL 5

Gene SH3BGR, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-206	ENST00000440288	AQP8	O94778	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	KCNK2	O95069	426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	ELK4	P28324	431 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	CCKAR	P32238	428 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	CARD18	P57730	90 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	TP53BP2	Q13625	1128 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	TRABD2A	Q86V40	505 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	GATS	Q8NAP1	163 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	OR4C3	Q8NH37	302 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	RNF145	Q96MT1	663 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	STAC	Q99469	402 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	MED17	Q9NVC6	651 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	EMCN	Q9ULC0	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	SMIM23	A6NLE4	172 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	TRIM13	O60858	407 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	SDC1	P18827	310 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	KRT4	P19013	534 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	ADH6	P28332	368 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	PTH2R	P49190	550 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	MLC1	Q15049	377 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	GALNTL6	Q49A17	601 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	FBXO30	Q8TB52	745 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	MZB1	Q8WU39	189 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	OSTF1	Q92882	214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	BTBD2	Q9BX70	525 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	GIN1	Q9NXP7	522 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	NTM	Q9P121	344 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	SIAH2	O43255	324 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	LY6G6D	O95868	133 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	IGKV1D-16	P01601	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	LINC00032	P0C843	101 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	IL32	P24001	234 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	DUSP5	Q16690	384 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	APOOL	Q6UXV4	268 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	GALNT10	Q86SR1	603 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	TDRP	Q86YL5	185 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	SLC43A2	Q8N370	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	ZNF611	Q8N823	705 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	MOAP1	Q96BY2	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	C12orf49	Q9H741	205 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	GP6	Q9HCN6	339 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	MED12	Q93074	2177 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	HS3ST1	O14792	307 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	PRKD3	O94806	890 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	FAM153B	P0C7A2	387 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	ACP2	P11117	423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BGR-206	ENST00000440288	AGTR1	P30556	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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