RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 KDM5DQ9BY66 1539 aa4.04□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 FGD6Q6ZV73 1430 aa4.04□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 LRP5LA4QPB2 252 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 GLTPD2A6NH11 291 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF879B4DU55 563 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 PDLIM1O00151 329 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 HAS3O00219 553 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 CLDN9O95484 217 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 CSTAP01040 98 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 NPPAP01160 153 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 CRYGCP07315 174 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 MSR1P21757 451 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 CHMLP26374 656 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR183P32249 361 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 ID1P41134 155 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 CRYBB2P43320 205 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS5P46782 204 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 EMDP50402 254 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf61Q13536 156 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 CRMP1Q14194 572 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 MICBQ29980 383 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 ACCSLQ4AC99 568 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 HIKESHIQ53FT3 197 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 BEND3Q5T5X7 828 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 WLSQ5T9L3 541 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 AGBL2Q5U5Z8 902 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM53Q6P2H8 277 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 UTS2BQ765I0 119 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 SSX9Q7RTT3 188 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D10CQ8IV04 446 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2L3Q8NG85 312 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 GLYATL2Q8WU03 294 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 TADA1Q96BN2 335 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 SGK3Q96BR1 496 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 SDSLQ96GA7 329 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 PRRC1Q96M27 445 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 TECTBQ96PL2 329 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 GAL3ST1Q99999 423 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR174Q9BXC1 333 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 Q9HAA7 133 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 GALPQ9UBC7 116 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM135AQ9P2D6 1515 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa4.03□□□□□ -1.76
CBX1P4-201ENST00000439415 TIAM1Q13009 1591 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MAST1Q9Y2H9 1570 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 GRIN2DO15399 1336 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 FRMPD4Q14CM0 1322 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF840PA6NDX5 716 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 FRG2CA6NGY1 282 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TM9SF1O15321 606 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MSH4O15457 936 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TAPBPO15533 448 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CIDEAO60543 219 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 FZD7O75084 574 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 H6PDO95479 791 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NUDT3O95989 172 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 TOMM40O96008 361 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 OAS1P00973 400 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NGFP01138 241 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ALOX5P09917 674 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF853P0CG23 659 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 BCKDHAP12694 445 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SAA4P35542 130 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 LONP1P36776 959 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 NAMPTP43490 491 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PDLIM4P50479 330 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 XGP55808 180 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CSNK2BP67870 215 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PHEXP78562 749 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 LIPEQ05469 1076 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 DPTQ07507 201 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 RGS1Q08116 209 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 GCKRQ14397 625 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 GK3PQ14409 553 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC6Q16204 474 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 SLX4IPQ5VYV7 408 aa4.02□□□□□ -1.77
CBX1P4-201ENST00000439415 PLCXD3Q63HM9 321 aa4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms