RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 QSOX2Q6ZRP7 698 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF144BQ7Z419 303 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HEATR5AQ86XA9 2040 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEX9Q8N6V9 391 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF321PQ8N8H1 164 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAXEQ8NCW5 288 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MDS2Q8NDY4 140 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPV3Q8NET8 790 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2L5Q8NG80 312 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4K1Q8NGD4 311 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFT81Q8WYA0 676 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCLNQ969V3 563 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNFT2Q96EX2 444 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GAL3ST4Q96RP7 486 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HBEGFQ99075 208 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAFAH2Q99487 392 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FMO2Q99518 471 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR8D2Q9GZM6 311 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR51B5Q9H339 312 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTR8Q9H981 624 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMP25Q9NPA2 562 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF14Q9UBS8 474 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC14L3Q9UDX4 400 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC13A4Q9UKG4 626 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXW2Q9UKT8 454 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSF4Q9ULV5 492 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPA1Q9UND3 350 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 DTX4Q9Y2E6 619 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A096LPK6 155 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRIT2A6NDA9 550 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A7PA6NKC0 464 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 A6NLC8 198 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 C17orf100A8MU93 164 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A22PA8MWA6 464 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A12PA8MX19 464 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM49D1C9J1S8 452 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8RI6L899 631 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 K7EPI3 171 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 WWP2O00308 870 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLPP1O14494 284 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HS6ST1O60243 411 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NME2P1O60361 137 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC19A2O60779 497 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2J2O76002 312 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEURL1O76050 574 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6B1O95007 311 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2P06681 752 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 INHBAP08476 426 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSTA2P09210 222 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHOXF2BP0C7M4 288 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP4B1P13584 511 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ICAM2P13598 275 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABOP16442 354 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPN2P22792 545 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPGP29372 298 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOX3P41225 446 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS6KA3P51812 740 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTTPP55157 894 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF17Q02223 184 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAV1Q03135 178 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 STX4Q12846 297 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAB1Q13506 487 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTF2H2Q13888 395 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NNATQ16517 81 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 C3AR1Q16581 482 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGO1Q5FBB7 561 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TECRLQ5HYJ1 363 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAGE2BQ5JRK9 111 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH2D4BQ5SQS7 431 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRTP1Q5TC63 336 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIPMQ5VYY2 423 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 C18orf63Q68DL7 685 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SULT1C3Q6IMI6 304 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.07□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED27Q6P2C8 311 aa4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms