RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 MAPK14Q16539 360 aa8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.85□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ULK3Q6PHR2 472 aa8.85□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.85□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.85□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 U3KQV3 271 aa8.85□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 M0R3H8 397 aa8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 AGRPO00253 132 aa8.84□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 IGF2P01344 180 aa8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 LINGO3P0C6S8 592 aa8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ITGAMP11215 1152 aa8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 COX6A1P12074 109 aa8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TNFRSF1BP20333 461 aa8.84□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 KEAP1Q14145 624 aa8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 OR1Q1Q15612 314 aa8.84□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 KRT80Q6KB66 452 aa8.84□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.84□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.84□□□□□ -0.99
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HDLBP-211ENST00000425989 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SDK2Q58EX2 2172 aa8.83□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 PTPRBP23467 1997 aa8.83□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.83□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 J3KTA2 159 aa8.83□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 SOCS6O14544 535 aa8.83□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFB5O43674 189 aa8.83□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 CHP2O43745 196 aa8.83□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 OR10H3O60404 316 aa8.83□□□□□ -1
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