RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 UGT2B4P06133 528 aa3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 CLUP10909 449 aa3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 PTPN6P29350 595 aa3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 PTGFRP43088 359 aa3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 XCR1P46094 333 aa3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 NOP14P78316 857 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 ZMYND11Q15326 602 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 CCDC152Q4G0S7 254 aa3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 NIPAL3Q6P499 406 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-204ENST00000422939 CEND1Q8N111 149 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 ZNF607Q96SK3 696 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRPS1-204ENST00000422939 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.833e-6■■■■■ 80.4
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TRPS1-204ENST00000422939 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
TRPS1-204ENST00000422939 OR10H1Q9Y4A9 318 aa3.58□□□□□ -1.84
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