RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 MARK4Q96L34 752 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 TSSK3Q96PN8 268 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 BBS4Q96RK4 519 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 MDFIQ99750 246 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 CXorf56Q9H5V9 222 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 KCNK9Q9NPC2 374 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 FANCFQ9NPI8 374 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 STOML1Q9UBI4 398 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 GIMAP2Q9UG22 337 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZNF337Q9Y3M9 751 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 DSCAMO60469 2012 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 OR2M5A3KFT3 312 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 C17orf51A8MQB3 221 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 B4DXG7 233 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 H0YC42 278 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 UPK1AO00322 258 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 KLF11O14901 512 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PEX11AO75192 247 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 CGAP01215 116 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PRPS2P11908 318 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 TBXA2RP21731 343 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 MAPK1P28482 360 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 NTSP30990 170 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 RPL14P50914 215 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 NR1H2P55055 460 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PSG6Q00889 435 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 OCRLQ01968 901 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 EMX2Q04743 252 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 STX3Q13277 289 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 SGCBQ16585 318 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 DECR1Q16698 335 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 GALNTL6Q49A17 601 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 BEX5Q5H9J7 111 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PPP4R4Q6NUP7 873 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZNF610Q8N9Z0 462 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 OR4N2Q8NGD1 307 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PSMA8Q8TAA3 256 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ARL8AQ96BM9 186 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ZBTB9Q96C00 473 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ELP4Q96EB1 424 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 Q9N2J8 555 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 MED11Q9P086 117 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 AP4B1Q9Y6B7 739 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 ATRQ13535 2644 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-204ENST00000403441 COL6A5A8TX70 2615 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD28O15084 1053 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 PDPK1O15530 556 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 FADS1O60427 444 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 TMCC2O75069 709 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 RPL3P39023 403 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.642e-8■□□□□ 8.3
PRAME-204ENST00000403441 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 CTBP2P56545 445 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 CLDN15P56746 228 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 CLDN20P56880 219 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 PTGR1Q14914 329 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 GUSBP1Q15486 140 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 HHATQ5VTY9 493 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD34AQ69YU3 496 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 OGFOD2Q6N063 350 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 METTL25Q8N6Q8 603 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 OR5M1Q8NGP8 315 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 PPCDCQ96CD2 204 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 COQ8BQ96D53 544 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 GIMAP5Q96F15 307 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 PRRG4Q9BZD6 226 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 MEAF6Q9HAF1 191 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-204ENST00000403441 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms