RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402583.5

CBX1-203, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene CBX1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-203ENST00000402583 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 OR5T3Q8NGG3 340 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 OR52N1Q8NH53 320 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 RNF217Q8TC41 542 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 FANK1Q8TC84 345 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SAMD8Q96LT4 415 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 KCTD7Q96MP8 289 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 NELL2Q99435 816 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SLC30A2Q9BRI3 323 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 JAM3Q9BX67 310 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TRIM2Q9C040 744 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SMURF1Q9HCE7 757 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.64□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 LILRA5A6NI73 299 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TBX1O43435 398 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CHP2O43745 196 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PIP5K1CO60331 668 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 HCN1O60741 890 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PRAMEF2O60811 474 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CTNSO60931 367 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 DNAJB6O75190 326 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 RDH16O75452 317 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 NSA2O95478 260 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CSF2P04141 144 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PROS1P07225 676 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 IFI30P13284 250 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TYRP1P17643 537 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CD27P26842 260 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 GABRA5P31644 462 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SLC1A3P43003 542 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CAPZBP47756 277 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 FASLGP48023 281 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 GAS1P54826 345 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CTBP2P56545 445 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 IFITM3Q01628 133 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 ACSM1Q08AH1 577 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SLC13A2Q13183 592 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 C1orf61Q13536 156 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 FAM53BQ14153 422 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 MAPK14Q16539 360 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PRTGQ2VWP7 1150 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TCTE1Q5JU00 501 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 HSDL2Q6YN16 418 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CCDC190Q86UF4 302 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 C11orf74Q86VG3 221 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CMIPQ8IY22 773 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 POC5Q8NA72 575 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 RIT1Q92963 219 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 WDFY2Q96P53 400 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 DGAT2Q96PD7 388 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 LRRC61Q9BV99 259 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 OR52D1Q9H346 318 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 UBQLN3Q9H347 655 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 FOLH1BQ9HBA9 442 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 Q9N2J8 555 aa8.63□□□□□ -1.03
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CBX1-203ENST00000402583 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 EPHA6Q9UF33 1036 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PLCL2Q9UPR0 1127 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 GPR52Q9Y2T5 361 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CMAHPQ9Y471 501 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.63□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.62□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 GXYLT2A0PJZ3 443 aa8.62□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.62□□□□□ -1.03
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