RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 TRPV4Q9HBA0 871 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 GDE1Q9NZC3 331 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 OR6C2Q9NZP2 312 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 FAM157BP0CG42 384 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 FUT1P19526 365 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SEC13P55735 322 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 CTBP2P56545 445 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SMARCD3Q6STE5 483 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SDF2Q99470 211 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 TBX5Q99593 518 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 PRSS27Q9BQR3 290 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 ALG8Q9BVK2 526 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 KCNN2Q9H2S1 579 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SLA2Q9H6Q3 261 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 FGF22Q9HCT0 170 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 BABAM2Q9NXR7 383 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF24P17028 368 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 DUSP8Q13202 625 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 NIPAL3Q6P499 406 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 OR52L1Q8NGH7 329 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 KCNJ15Q99712 375 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SLC6A17Q9H1V8 727 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 KCMF1Q9P0J7 381 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 TRAPPC13A5PLN9 417 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 OR6C70A6NIJ9 312 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SGK494L7N484 410 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 APODP05090 189 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 PRG2P13727 222 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 FXYD6P3P58550 94 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 ADAM15Q13444 863 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 ENPP2Q13822 863 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 IDNKQ5T6J7 187 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 TCTE3Q8IZS6 198 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM99Q8N816 258 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 YIPF7Q8N8F6 280 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 TBC1D29Q9UFV1 150 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 PHF11Q9UIL8 331 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 SLC35G6P0C7Q6 338 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 ELK1P19419 428 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 CLDN20P56880 219 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 DEFB134Q4QY38 66 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 Q5BKY6 102 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 WDR88Q6ZMY6 472 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 NR2C2APQ86WQ0 139 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 PFN4Q8NHR9 129 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 NT5CQ8TCD5 201 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 ACOT12Q8WYK0 555 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 UPRTQ96BW1 309 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 CD180Q99467 661 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 KLHL21Q9UJP4 597 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf40-201ENST00000376854 EML2O95834 649 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 THBS1P07996 1170 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 GKN3PP0CG01 181 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 MAKP20794 623 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 MTNR1BP49286 362 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 MAPK14Q16539 360 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 YIF1BQ5BJH7 314 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 HS6ST2Q96MM7 605 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 NDEL1Q9GZM8 345 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 ENKD1Q9H0I2 346 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 C20orf141Q9NUB4 165 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 BHLHE40O14503 412 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 CHRNB1P11230 501 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 HTR2AP28223 471 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 TRILQ7L0X0 811 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 DOK4Q8TEW6 326 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 TIMP4Q99727 224 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 FN3KQ9H479 309 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 EXTL2Q9UBQ6 330 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 KLF15Q9UIH9 416 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 SLC31A1O15431 190 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 HRO43593 1189 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 DNAJB6O75190 326 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 IFI30P13284 250 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 BMP7P18075 431 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 RUNX2Q13950 521 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 YAF2Q8IY57 180 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM239Q8WW34 195 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 OR2M4Q96R27 311 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf40-201ENST00000376854 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms