RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375011.3

GALNT12-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT12, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT12-201ENST00000375011 SDE2Q6IQ49 451 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 BEX2Q9BXY8 128 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 OR52D1Q9H346 318 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 SLC16A1P53985 500 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 SCN1BQ07699 218 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 FZD5Q13467 585 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 KLHL12Q53G59 568 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 VASNQ6EMK4 673 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 ZAR1Q86SH2 424 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF614Q8N883 585 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 FAM3CQ92520 227 aa21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
GALNT12-201ENST00000375011 GABRPO00591 440 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 HCRTR1O43613 425 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 KCNJ13O60928 360 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 REM1O75628 298 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 SHC2P98077 582 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 RAB43Q86YS6 212 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 NEIL3Q8TAT5 605 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 RFKQ969G6 155 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 KRT8P05787 483 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 CTSBP07858 339 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 CT62P0C5K7 136 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 IFI30P13284 250 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 GJD3Q8N144 294 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 RBCK1Q9BYM8 510 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 CDH10Q9Y6N8 788 aa21.51■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 H0YGG7 62 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 OR5F1O95221 314 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 NFATC4Q14934 902 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 SHHQ15465 462 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 DCST2Q5T1A1 773 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 CNIH2Q6PI25 160 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 GRHL3Q8TE85 626 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 ELSPBP1Q96BH3 223 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 TM4SF19Q96DZ7 209 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 WDR92Q96MX6 357 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 SERINC2Q96SA4 455 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 PRRG3Q9BZD7 231 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 ACTR10Q9NZ32 417 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 GXYLT2A0PJZ3 443 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 MEIOCA2RUB1 952 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 C12orf71A8MTZ7 269 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 DSG2Q14126 1118 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 THSD4Q6ZMP0 1018 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 TRIM48Q8IWZ4 208 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 KLHL36Q8N4N3 616 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 TMEM99Q8N816 258 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 NT5CQ8TCD5 201 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 NLGN3Q9NZ94 848 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF221Q9UK13 617 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 BOLA1Q9Y3E2 137 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 SLC22A7Q9Y694 548 aa21.5■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 CLUP10909 449 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 TBXA2RP21731 343 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 ARFIP1P53367 373 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 OR1Q1Q15612 314 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF544Q6NX49 715 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 XKRXQ6PP77 449 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 COX18Q8N8Q8 333 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 SETD6Q8TBK2 473 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 PHF11Q9UIL8 331 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 TRAV27A0A087WT01 109 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 PLA2G10O15496 165 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 SMIM10L1P0DMW3 83 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 HTR1FP30939 366 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 TNFRSF4P43489 277 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.032e-6■□□□□ 10.7
GALNT12-201ENST00000375011 SMUG1Q53HV7 270 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF628Q5EBL2 1059 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 OR13C2Q8NGS9 318 aa21.49■■□□□ 1.03
GALNT12-201ENST00000375011 OR51A7Q8NH64 312 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms