RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NPY1RP25929 384 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CSNK1G2P78368 415 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VLDLRP98155 873 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF154Q13106 437 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PSG5Q15238 335 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TOMM20Q15388 145 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRSS8Q16651 343 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF699Q32M78 642 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF880Q6PDB4 577 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NEGR1Q7Z3B1 354 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HOOK3Q86VS8 718 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VRK2Q86Y07 508 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BPIFB2Q8N4F0 458 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR52P1PQ8NH57 321 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMEM37Q8WXS4 190 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SMARCD2Q92925 531 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HIST1H2ACQ93077 130 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TEKT1Q969V4 418 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C5orf30Q96GV9 206 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GPR137Q96N19 417 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RNF126Q9BV68 326 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MAGEF1Q9HAY2 307 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MIOXQ9UGB7 285 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FKBP7Q9Y680 259 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GRIN2DO15399 1336 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 METP08581 1390 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 I3L1I5 382 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LAD1O00515 517 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CHEK1O14757 476 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 B4GALT5O43286 388 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SNAPINO95295 136 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CISD3P0C7P0 127 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CRISP2P16562 243 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CRISP3P54108 245 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ST8SIA6P61647 398 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RPL8P62917 257 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 WASHC5Q12768 1159 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TFCP2Q12800 502 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KARSQ15046 597 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF789Q5FWF6 425 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CASC10Q5T4H9 136 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C6orf89Q6UWU4 347 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 Q6ZR03 302 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GDPD3Q7L5L3 318 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ARCQ7LC44 396 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IFNEQ86WN2 208 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PNKDQ8N490 385 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OR9A4Q8NGU2 314 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GIMAP1Q8WWP7 306 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IL1F10Q8WWZ1 152 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ATP6V0A1Q93050 837 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCDC114Q96M63 670 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DEFB118Q96PH6 123 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NPAS2Q99743 824 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NRIP2Q9BQI9 281 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC25A22Q9H936 323 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RIMS3Q9UJD0 308 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 USP16Q9Y5T5 823 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PLA2R1Q13018 1463 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ESYT2A0FGR8 921 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C7orf66A4D0T2 115 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SULT2B1O00204 365 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TLR4O00206 839 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC28A1O00337 649 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TNFSF13O75888 250 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 APOA4P06727 396 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GIPP09681 153 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EFNB2P52799 333 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ST3GAL3Q11203 375 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZP4Q12836 540 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 UBE2V2Q15819 145 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM120AOSQ5T036 256 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PVRIGQ6DKI7 326 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NANOGP8Q6NSW7 305 aa0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms