RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC74AQ0VAA2 488 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 RCAN2Q14206 197 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 PDZK1Q5T2W1 519 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 AAGABQ6PD74 315 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 CBLN3Q6UW01 205 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 LIX1LQ8IVB5 337 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 TRIML2Q8N7C3 387 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 TNIP2Q8NFZ5 429 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZFP90Q8TF47 636 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 TRIB1Q96RU8 372 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 UCK2Q9BZX2 261 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 SLC52A3Q9NQ40 469 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC167Q9P0B6 97 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 MED12Q93074 2177 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 H0Y3Z8 333 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 H0YC42 278 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 NR5A2O00482 541 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 HCRTR2O43614 444 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 STX11O75558 287 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 EPPINO95925 133 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 AK1P00568 194 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 CAPN3P20807 821 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 CHMP24386 653 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 CHRNB4P30926 498 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 PTGER4P35408 488 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM44Q2T9K0 475 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 C6orf10Q5SRN2 563 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 CGB2Q6NT52 195 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ENPP6Q6UWR7 440 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ANKFN1Q8N957 763 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 GTF2H4Q92759 462 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF524Q96C55 264 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ROPN1LQ96C74 230 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ARSGQ96EG1 525 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 HOXD1Q9GZZ0 328 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 EXD2Q9NVH0 621 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 CARD8Q9Y2G2 431 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF337Q9Y3M9 751 aa24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 NKX2-6A6NCS4 301 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 UGT2B17O75795 530 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN15P56746 228 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 MAPK14Q16539 360 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 HSP90B2PQ58FF3 399 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 FRRS1Q6ZNA5 592 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 UBQLNLQ8IYU4 475 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF527Q8NB42 609 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 STON2Q8WXE9 905 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 DTNBP1Q96EV8 351 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ITCHQ96J02 903 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF385DQ9H6B1 395 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 RMND5AQ9H871 391 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 MED17Q9NVC6 651 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 DTNAQ9Y4J8 743 aa24.39■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 FREM3P0C091 2139 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0G2JND7 137 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 H3BML4 177 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA0513O60268 411 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ZCCHC18P0CG32 403 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ATP4BP51164 291 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 SQLEQ14534 574 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF141Q15928 474 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 SYPL1Q16563 259 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 PLPPR5Q32ZL2 321 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ATAD3BQ5T9A4 648 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 MISPQ8IVT2 679 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ASB5Q8WWX0 329 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ZG16BQ96DA0 208 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 NMUR2Q9GZQ4 415 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 MED4Q9NPJ6 270 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ICAM5Q9UMF0 924 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 WDR45Q9Y484 360 aa24.38■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 SERINC4A6NH21 518 aa24.37■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 ANP32DO95626 131 aa24.37■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 AGR2O95994 175 aa24.37■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 CHRM4P08173 479 aa24.37■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TPGS1-201ENST00000359315 CHRNEQ04844 493 aa24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms