RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf146Q5VVC0 180 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TIGD3Q6B0B8 471 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR52P1PQ8NH57 321 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ROBO4Q8WZ75 1007 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PHF21AQ96BD5 680 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TIMD4Q96H15 378 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CXorf56Q9H5V9 222 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WV48 116 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PNR3 127 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RAD51DO75771 328 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CYB5AP00167 134 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 IFNW1P05000 195 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CRYBA1P05813 215 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SBK3P0C264 359 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DDCP20711 480 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CHRNB4P30926 498 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT6P53370 316 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CORO7P57737 925 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LETMD1Q6P1Q0 360 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SBSNQ6UWP8 590 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf89Q6UX73 402 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01560Q8TB33 94 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CDS1Q92903 461 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CSF3RQ99062 836 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf27Q9GZN8 174 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC90BQ9GZT6 254 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RAB33BQ9H082 229 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NANSQ9NR45 359 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DECR2Q9NUI1 292 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 UNC80Q8N2C7 3258 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PR48 441 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf97H3BN30 126 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF264O43296 627 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TBX1O43435 398 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN14O95500 239 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 IFNGP01579 166 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 LAMP1P11279 417 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 EDN3P14138 238 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF83P51522 516 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 BLVRAP53004 296 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PIGFQ07326 219 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP8Q13202 625 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf136Q5SQH8 315 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NIPAL3Q6P499 406 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 QSOX2Q6ZRP7 698 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SPATC1Q76KD6 591 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD11Q8NFV4 315 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR6K6Q8NGW6 343 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR52J3Q8NH60 311 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RASSF5Q8WWW0 418 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GATA6Q92908 595 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RNF145Q96MT1 663 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RHNO1Q9BSD3 238 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ULBP2Q9BZM5 246 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 AKTIPQ9H8T0 292 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 BRF2Q9HAW0 419 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PCTPQ9UKL6 214 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 MED31Q9Y3C7 131 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD65E5RJM6 399 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 E2F3O00716 465 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PPP6CO00743 305 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR2T1O43869 369 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PPM1BO75688 479 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DXOO77932 396 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ATE1O95260 518 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TGDSO95455 350 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RENP00797 406 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FPR1P21462 350 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GNALP38405 381 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DCTP40126 519 aa4.08□□□□□ -1.76
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