RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
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PTPRU-201ENST00000345512 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.085e-7■□□□□ 10
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PTPRU-201ENST00000345512 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.54□□□□□ -0.08
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PTPRU-201ENST00000345512 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 A8MUA0 341 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 TFP02787 698 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 HBQ1P09105 142 aa14.53□□□□□ -0.08
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PTPRU-201ENST00000345512 PTPN6P29350 595 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 SOX18P35713 384 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 PDE7AQ13946 482 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF550Q7Z398 422 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 DGAT2Q96PD7 388 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 BTBD2Q9BX70 525 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.53□□□□□ -0.08
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