RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.97□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 CNR2P34972 360 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 GNB2P62879 340 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 PTPRRQ15256 657 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9.96□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 SLC5A8Q8N695 610 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.96□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 HCSTQ9UBK5 93 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 SLC22A2O15244 555 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 SERPINE2P07093 398 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 RAB31Q13636 194 aa9.96□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 NETO1Q8TDF5 533 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 OLAHQ9NV23 265 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 STUB1Q9UNE7 303 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 GPR39O43194 453 aa9.96□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 MYOGP15173 224 aa9.96□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 ALKBH6Q3KRA9 238 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 ACBD4Q8NC06 268 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 ZNF382Q96SR6 550 aa9.96□□□□□ -0.81
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CLN8-201ENST00000331222 KCND1Q9NSA2 647 aa9.96□□□□□ -0.81
CLN8-201ENST00000331222 DUOX1Q9NRD9 1551 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 FAM183AA6NL82 134 aa9.96□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 EFSO43281 561 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 DPP4P27487 766 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 IRF4Q15306 451 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PTERQ96BW5 349 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.96□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 STT3BQ8TCJ2 826 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CHFRQ96EP1 664 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 OR10A5Q9H207 317 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 OR10A2Q9H208 303 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SLIT2O94813 1529 aa9.96□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CER1O95813 267 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 LAMP1P11279 417 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 OMGP23515 440 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ACTC1P68032 377 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ACTA1P68133 377 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 DMWDQ09019 674 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 MBTPS1Q14703 1052 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SPHARQ15513 63 aa9.95□□□□□ -0.82
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CLN8-201ENST00000331222 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 OR2T4Q8NH00 348 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 AGAP4Q96P64 663 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 CD300LBA8K4G0 201 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 ATP6V1G1O75348 118 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 F13BP05160 661 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 HTR2BP41595 481 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TUBA1BP68363 451 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TUBA4AP68366 448 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 TUBA1AQ71U36 451 aa9.95□□□□□ -0.82
CLN8-201ENST00000331222 OR2T27Q8NH04 317 aa9.95□□□□□ -0.82
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