RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 A0A0B4J293 547 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 HTR3BO95264 441 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 IFNA17P01571 189 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CLDN12P56749 244 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 FXYD6P3P58550 94 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 HYAL4Q2M3T9 481 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TP53I3Q53FA7 332 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 FCRLAQ7L513 359 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TPRA1Q86W33 373 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 RNF31Q96EP0 1072 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 IL17CQ9P0M4 197 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 A0A0D9SG52 128 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SLC22A23A1A5C7 686 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 POM121BA6NF01 834 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ARAFP10398 606 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR10A3P58181 314 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 VASNQ6EMK4 673 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CYB561A3Q8NBI2 242 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR11H4Q8NGC9 324 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TMEM27Q9HBJ8 222 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 GKN1Q9NS71 199 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CACNA1CQ13936 2221 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 KDELR3O43731 214 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 PTP4A3O75365 173 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SOD1P00441 154 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 THEGLP0DJG4 465 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 HSD3B2P26439 372 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CLCNKAP51800 687 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ADAM5Q6NVV9 412 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR10R2Q8NGX6 335 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 RELTQ969Z4 430 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 LMAN2LQ9H0V9 348 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 RHBGQ9H310 441 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZFP57Q9NU63 452 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TMEM184CQ9NVA4 438 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ASB6Q9NWX5 421 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 A0A1B0GVT2 93 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TSTD3H0UI37 97 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 UBXN7O94888 489 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CCR4P51679 360 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.091e-11■□□□□ 11.2
PACS1-201ENST00000320580 MAP2K5Q13163 448 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TMEM200AQ86VY9 491 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 BPIFCQ8NFQ6 507 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CALML5Q9NZT1 146 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CAMK2AQ9UQM7 478 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 PCM1Q15154 2024 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 KLK8O60259 260 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ACHEP22303 614 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CD52P31358 61 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 MAPK9P45984 424 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SELENOPP49908 381 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 RHEBQ15382 184 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 GLT8D1Q68CQ7 371 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 FAAP20Q6NZ36 180 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR4Q3Q8NH05 313 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR6S1Q8NH40 331 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 GIMAP5Q96F15 307 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 C4orf36Q96KX1 117 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 COMMD4Q9H0A8 199 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ASIC5Q9NY37 505 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 GLOD5A6NK44 160 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SLC22A31A6NKX4 558 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 FAM74A7A6NL05 159 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZNF254O75437 659 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ITGB7P26010 798 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CCR8P51685 355 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 FAM74A3Q4VXF1 159 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SYNPRQ8TBG9 265 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 C16orf78Q8WTQ4 265 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SFT2D1Q8WV19 159 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR5P2Q8WZ92 322 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.6■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.59■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 AMY2AP04746 511 aa15.59■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 IFNGR1P15260 489 aa15.59■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 KCNJ3P48549 501 aa15.59■□□□□ 0.09
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