RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CMIPQ8IY22 773 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PARP8Q8N3A8 854 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 BCORP1Q8N888 145 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF527Q8NB42 609 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1N1Q8NGS0 311 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF721Q8TF20 911 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35B4Q969S0 331 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 LRFN5Q96NI6 719 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PRRX2Q99811 253 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CTRCQ99895 268 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZPBPQ9BS86 351 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ITPAQ9BY32 194 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087WXM4 84 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3PXD2BA1X283 911 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CDHR4A6H8M9 788 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FRG2CA6NGY1 282 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 VSTM2BA6NLU5 285 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 C9J4A7 227 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX12O00623 359 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TPST2O60704 377 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA7AO75326 666 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TIAF1O95411 115 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 EPPINO95925 133 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 POU2F1P14859 743 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTM3P21266 225 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT2B15P54855 530 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CSNK2BP67870 215 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 11.1
RABGGTB-201ENST00000319942 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK14Q16539 360 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC157Q569K6 752 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF691Q5VV52 312 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 COX15Q7KZN9 410 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF550Q7Z398 422 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 NAXDQ8IW45 347 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF614Q8N883 585 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 BMPERQ8N8U9 685 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPBAP1Q96EW2 488 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 WFDC6Q9BQY6 131 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF559Q9BR84 538 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DGCR6LQ9BY27 220 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 UCK2Q9BZX2 261 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR54Q9H977 334 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 APMAPQ9HDC9 416 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DTX4Q9Y2E6 619 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CHST2Q9Y4C5 530 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAPPC13A5PLN9 417 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 FRS3O43559 492 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 LRP3O75074 770 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 REM1O75628 298 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 IL33O95760 270 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 CLPSP04118 112 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK4P11802 303 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL4P13236 92 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP4B1P13584 511 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 CBLP22681 906 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC5A2P31639 672 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 NR1H2P55055 460 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 ISL1P61371 349 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 TUBA4AP68366 448 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-201ENST00000319942 IL5RAQ01344 420 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms