RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 OR2M3Q8NG83 312 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 GPR137Q96N19 417 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 RLIMQ9NVW2 624 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 LIPT1Q9Y234 373 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.27□□□□□ -1.09
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PDE4D-201ENST00000309641 ESPL1Q14674 2120 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PQD3 144 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 SERINC4A6NH21 518 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 AGAP5A6NIR3 686 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 HCRTR2O43614 444 aa8.27□□□□□ -1.09
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PDE4D-201ENST00000309641 PPIBP23284 216 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 PRDX6P30041 224 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 LCN1P31025 176 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 HPCAP84074 193 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF117Q03924 483 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 SLC10A1Q14973 349 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 ARSKQ6UWY0 536 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 COMTD1Q86VU5 262 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 OR5M1Q8NGP8 315 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF583Q96ND8 569 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 GID8Q9NWU2 228 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 SEC14L3Q9UDX4 400 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1B0GTH9 108 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 ACOT7O00154 380 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 NME4O00746 187 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 ZIC3O60481 467 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 CBR3O75828 277 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 PLA2G2AP14555 144 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 GNLYP22749 145 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 MAGEA8P43361 318 aa8.26□□□□□ -1.09
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PDE4D-201ENST00000309641 CRISP3P54108 245 aa8.26□□□□□ -1.09
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PDE4D-201ENST00000309641 SLC25A3Q00325 362 aa8.26□□□□□ -1.09
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PDE4D-201ENST00000309641 SCARB2Q14108 478 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 FGFBP1Q14512 234 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 CYP51A1Q16850 503 aa8.26□□□□□ -1.09
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PDE4D-201ENST00000309641 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 RNF148Q8N7C7 305 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF527Q8NB42 609 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 OR8J3Q8NGG0 315 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 ECSITQ9BQ95 431 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 POLE3Q9NRF9 147 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.26□□□□□ -1.09
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PDE4D-201ENST00000309641 CYP7B1O75881 506 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 CSTAP01040 98 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 HPNP05981 417 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 GUSBP08236 651 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 UBL4AP11441 157 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 DPP4P27487 766 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 PGM1P36871 562 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 CRYBA2P53672 197 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 KCNJ10P78508 379 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 CBX1P83916 185 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 SKP2Q13309 424 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 KRT72Q14CN4 511 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 DCST1Q5T197 706 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 GFRALQ6UXV0 394 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 TRILQ7L0X0 811 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-201ENST00000309641 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.25□□□□□ -1.09
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