RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 SLC10A1Q14973 349 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 REEP3Q6NUK4 255 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 BBS10Q8TAM1 723 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 GPR137Q96N19 417 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 UBQLN3Q9H347 655 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 SEC14L3Q9UDX4 400 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 DSPPQ9NZW4 1301 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 AGAP5A6NIR3 686 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 HCRTR2O43614 444 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 PGM3O95394 542 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 EDN3P14138 238 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 IL7RP16871 459 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 MXRA7P84157 204 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 IGFBP7Q16270 282 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 ZZZ3Q8IYH5 903 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 OR2M3Q8NG83 312 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 PMM1Q92871 262 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 MIB2Q96AX9 1013 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 NSL1Q96IY1 281 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 LDAHQ9H6V9 325 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 PTGES2Q9H7Z7 377 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 HHATLQ9HCP6 504 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 BCL2L10Q9HD36 194 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 CMTM6Q9NX76 183 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 DKKL1Q9UK85 242 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 CYP7B1O75881 506 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 CSTAP01040 98 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 UBL4AP11441 157 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 AQP1P29972 269 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 MNAT1P51948 309 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 SLC7A2P52569 658 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 PSME3P61289 254 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF117Q03924 483 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 RBBP4Q09028 425 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 FGFBP1Q14512 234 aa20.33■□□□□ 0.85
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HOXD4-201ENST00000306324 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 FADS6Q8N9I5 356 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 HIPK4Q8NE63 616 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 OR52P1PQ8NH57 321 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 OIT3Q8WWZ8 545 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA9Q9BWV2 254 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 EXO5Q9H790 373 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 LIPGQ9Y5X9 500 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXD4-201ENST00000306324 ESPL1Q14674 2120 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 CLDN24A6NM45 220 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF264O43296 627 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 OIP5O43482 229 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 GZMMP51124 257 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 KCNJ10P78508 379 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 HSF1Q00613 529 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 CBLN3Q6UW01 205 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 GFRALQ6UXV0 394 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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HOXD4-201ENST00000306324 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO27Q8NI29 283 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF583Q96ND8 569 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 USP22Q9UPT9 525 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 HPNP05981 417 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 DPP4P27487 766 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 CBX1P83916 185 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 VMACQ2NL98 169 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 CALHM3Q86XJ0 350 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 VRK2Q86Y07 508 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 KRT73Q86Y46 540 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 GHDCQ8N2G8 530 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 OR14L1PQ8NHC6 308 aa20.31■□□□□ 0.84
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