RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM64Q6YI46 380 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM74Q86UV6 250 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52J3Q8NH60 311 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF675Q8TD23 568 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PIK3R3Q92569 461 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SGCDQ92629 289 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 BTBD2Q9BX70 525 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR26Q9H7D7 661 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM184CQ9NVA4 438 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CFL2Q9Y281 166 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0G2JPF8 293 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FUOMA2VDF0 154 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GSAPA4D1B5 854 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CCRL2O00421 344 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PLPP1O14494 284 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10H3O60404 316 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT2B17O75795 530 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GBAP04062 536 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FUCA1P04066 466 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPIND1P05546 499 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LCKP06239 509 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 BCHEP06276 602 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IMPDH2P12268 514 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NR4A1P22736 598 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 POU1F1P28069 291 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CMPK1P30085 196 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 AHRP35869 848 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TGFBR2P37173 567 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1E2P47887 323 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ5P48544 419 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB28P51157 221 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CLCNKAP51800 687 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 XKP51811 444 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR5P85299 388 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RHAGQ02094 409 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKCDQ05655 676 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RUNX1T1Q06455 604 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DNASE1L3Q13609 305 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IL10RAQ13651 578 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IRF3Q14653 427 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OXA1LQ15070 435 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL22Q53GT1 634 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RNLSQ5VYX0 342 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ADCK2Q7Z695 626 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.54□□□□□ -1.36
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