RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257264.3

TCN1-201, Transcript of transcobalamin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TCN1, Length 1,582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1-201ENST00000257264 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 FGL1Q08830 312 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 PJVKQ0ZLH3 352 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 KRT81Q14533 505 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 PDK2Q15119 407 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 P2RY14Q15391 338 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 OR1C1Q15619 314 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 MAPK6Q16659 721 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 KYAT1Q16773 422 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 GPR33Q49SQ1 333 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 DNAL1Q4LDG9 190 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 TMEM64Q6YI46 380 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 C1QL4Q86Z23 238 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CRLF3Q8IUI8 442 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 OR5B17Q8NGF7 314 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 OR13C5Q8NGS8 318 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 OR52N5Q8NH56 324 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 GRHL3Q8TE85 626 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 DCAKDQ8WVC6 231 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 STARD8Q92502 1023 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 PIK3R3Q92569 461 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 FAF2Q96CS3 445 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 NPY6RQ99463 290 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CCM2Q9BSQ5 444 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 WWP1Q9H0M0 922 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 VCX3BQ9H321 246 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 ZNF319Q9P2F9 582 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 SLC7A7Q9UM01 511 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 PARP14Q460N5 1801 aa4.55□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 MEI4A8MW99 385 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 WRBO00258 174 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 BIRC5O15392 142 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 FCMRO60667 390 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 MAGEC1O60732 1142 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 SMIM24O75264 130 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 LRCH4O75427 683 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 PSMG1O95456 288 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 T-ENOLP0DO92 83 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 PNMTP11086 282 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 UQCRC2P22695 453 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 LHCGRP22888 699 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CERS1P27544 350 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 ELK3P41970 407 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 OR1G1P47890 313 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 MYL6P60660 151 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 PPIAP62937 165 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 PLP2Q04941 152 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 PTPRJQ12913 1337 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 MEF2DQ14814 521 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 HKDC1Q2TB90 917 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 LRIT3Q3SXY7 679 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 AADACL4Q5VUY2 407 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CARD17Q5XLA6 110 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 TMEM225Q6GV28 225 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 BIVMQ86UB2 503 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 LRRC6Q86X45 466 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CTAGE3PQ8IX95 158 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CCDC36Q8IYA8 594 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 TMEM199Q8N511 208 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 C12orf42Q96LP6 360 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 OMDQ99983 421 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CALN1Q9BXU9 219 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 EHD1Q9H4M9 534 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.54□□□□□ -1.68
TCN1-201ENST00000257264 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms