RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF527Q8NB42 609 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR2L2Q8NH16 312 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 HSD17B8Q92506 261 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CACNG6Q9BXT2 260 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 UBQLN3Q9H347 655 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 DPP7Q9UHL4 492 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CHP2O43745 196 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 RGS11O94810 467 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CFDP00746 253 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR5J2Q8NH18 312 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR10G6Q8NH81 332 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR52D1Q9H346 318 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CREBZFQ9NS37 354 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 LRIT2A6NDA9 550 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC72A6NJI9 287 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SURF4O15260 269 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CLTBP09497 229 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKRD34CP0C6C1 535 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 PGGHGQ32M88 737 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 EOGTQ5NDL2 527 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 FRMD1Q8N878 549 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR5W2Q8NH69 310 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SUN3Q8TAQ9 357 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC35A4Q96G79 324 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 PTCHD1Q96NR3 888 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa16.18■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 PROM1O43490 865 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ST3GAL3Q11203 375 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MAPK14Q16539 360 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 RIT1Q92963 219 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 COQ10AQ96MF6 247 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 GON7Q9BXV9 100 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 STARD5Q9NSY2 213 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ING4Q9UNL4 249 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MEIS3P1A6NDR6 274 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP1R3DO95685 299 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ASGR2P07307 311 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MAKP20794 623 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TEAD1P28347 426 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OMPP47874 163 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR88Q6ZMY6 472 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 LINGO2Q7L985 606 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 C9orf62Q8N4C0 152 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ACBD7Q8N6N7 88 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR2T33Q8NG76 320 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR2T35Q8NGX2 323 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 KLHL28Q9NXS3 571 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SERGEFQ9UGK8 458 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR45Q9Y484 360 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 DENND4CQ5VZ89 1909 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 C4orf47A7E2U8 309 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 HCN1O60741 890 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 UCHL1P09936 223 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SEC13P55735 322 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPAN31Q12999 210 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 RASGRP3Q8IV61 690 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR4K13Q8NH42 304 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 DERL3Q96Q80 235 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ICKQ9UPZ9 632 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CACNG2Q9Y698 323 aa16.17■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM129A0AVI4 362 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 FZD7O75084 574 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 PAPLNO95428 1278 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 HPXP02790 462 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ADH5P11766 374 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 BMP7P18075 431 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 PRKACBP22694 351 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 HLA-DMAP28067 261 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 RPS27P42677 84 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TEKQ02763 1124 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF33BQ06732 778 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 IKBIPQ70UQ0 350 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 FANK1Q8TC84 345 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 INSL6Q9Y581 213 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A1W2PPV9 198 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MAN2B1O00754 1011 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MOSPD3O75425 235 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 DHFRP00374 187 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ADH1AP07327 375 aa16.16■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ATP12AP54707 1039 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms