RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	SHC2	P98077	582 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	PGGHG	Q32M88	737 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	C6orf183	Q5T699	404 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	OR2T33	Q8NG76	320 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	MALT1	Q9UDY8	824 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152		H0YGG7	62 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CASK	O14936	926 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TMCC2	O75069	709 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFV2	P19404	249 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	STAT5A	P42229	794 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CASP3	P42574	277 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	LSS	P48449	732 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SLC9A3	P48764	834 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	OR2B6	P58173	313 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1CA	P62136	330 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DS3	Q14952	304 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	NT5C	Q8TCD5	201 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	RFK	Q969G6	155 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TEX12	Q9BXU0	123 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SRR	Q9GZT4	340 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		12.19	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	HTR2A	P28223	471 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	RCVRN	P35243	200 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF136	P52737	540 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SLC16A1	P53985	500 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1024L	P59773	190 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TPBG	Q13641	420 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ALG11	Q2TAA5	492 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	COX18	Q8N8Q8	333 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TMCO6	Q96DC7	493 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	URAD	A6NGE7	173 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CCNK	O75909	580 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	OR5F1	O95221	314 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	DCST2	Q5T1A1	773 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD13	Q7L211	337 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	KLB	Q86Z14	1044 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	MMP28	Q9H239	520 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	OR52D1	Q9H346	318 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	UBQLN3	Q9H347	655 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CBLC	Q9ULV8	474 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		12.18	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CD8B2	A6NJW9	211 aa		12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	STK25	O00506	426 aa		12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	DVL2	O14641	736 aa		12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	DYRK3	O43781	588 aa		12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CD8B	P10966	210 aa		12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	GABRA5	P31644	462 aa		12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	RFX2	P48378	723 aa		12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TPMT	P51580	245 aa		12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		12.17	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL12	Q53G59	568 aa		12.17	□□□□□ -0.46

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