RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 LCA5Q86VQ0 697 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA3Q8NHX4 192 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR151Q8TDV0 419 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 EGLN2Q96KS0 407 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF145Q96MT1 663 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHDC3Q9BQ90 382 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM185BQ9H7F4 350 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 HEATR5AQ86XA9 2040 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WZY1 265 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PRB8 838 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMDEC1O15204 470 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNGR4O95473 234 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 IFI6P09912 130 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 AGTR1P30556 359 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K8P41279 467 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC29A2Q14542 456 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPPR5Q32ZL2 321 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD12Q6NUT3 480 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 IKBIPQ70UQ0 350 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNYL1Q8N7R7 359 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2V1Q8NHB1 315 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10A4Q9H209 315 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf49Q9H741 205 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GLRX2Q9NS18 164 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 MED17Q9NVC6 651 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMP3Q9UQV4 416 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR52Q9Y2T5 361 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0J9YW62 118 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC36A6NLP5 189 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFB5O43674 189 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NKX2-2O95096 273 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 RAC1P63000 192 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ALKBH2Q6NS38 261 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NOXRED1Q6NXP6 359 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM46Q7Z4K8 759 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ZAR1Q86SH2 424 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FANCFQ9NPI8 374 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf72A4D263 438 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 NGFRP08138 427 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPS2P11908 318 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC18A2Q05940 514 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 HBMQ6B0K9 141 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 STK32CQ86UX6 486 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO30Q8TB52 745 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 POC1BQ8TC44 478 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB8AQ96BR9 441 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 S100PBPQ96BU1 408 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF223E7ERA6 249 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBBP07437 444 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ACP2P11117 423 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKAG1P54619 331 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 VEZF1Q14119 521 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 TSC22D1Q15714 1073 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC12BQ2HXU8 276 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FIGNL1Q6PIW4 674 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP112Q8N8E3 955 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 EMCNQ9ULC0 261 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL27Q9Y4X3 112 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 USF3Q68DE3 2245 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ROS1P08922 2347 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 PDPK1O15530 556 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD2P08910 425 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 SHC1P29353 583 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 GPC1P35052 558 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 DMTNQ08495 405 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0040Q15053 153 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS26BQ4G0F5 336 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF385BQ569K4 471 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CPTPQ5TA50 214 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 CDRT4Q8N9R6 151 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM110BQ8TC76 370 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.86■■□□□ 1.25
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