RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 DIO3P55073 304 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CLDN8P56748 225 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TLE4Q04727 773 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 BST1Q10588 318 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MPP2Q14168 576 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MLC1Q15049 377 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP5Q16690 384 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CCNJQ5T5M9 372 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CES4AQ5XG92 561 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 GATSQ8NAP1 163 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OR2M3Q8NG83 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF559Q9BR84 538 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP26Q9BV47 211 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NUF2Q9BZD4 464 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DPY30Q9C005 99 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CALHM2Q9HA72 323 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PNPOQ9NVS9 261 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ENO4A6NNW6 628 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CLCA1A8K7I4 914 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 H3BML4 177 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SCDO00767 359 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 KCNK2O95069 426 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ANP32DO95626 131 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1D-16P01601 117 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 KRT16P08779 473 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 KITP10721 976 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PEPDP12955 493 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LBPP18428 481 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CHMP24386 653 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CTSSP25774 331 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 GFRA1P56159 465 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LAPTM4AQ15012 233 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SMU1Q2TAY7 513 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ATG16L1Q676U5 607 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CDC73Q6P1J9 531 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ARSKQ6UWY0 536 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MEIOBQ8N635 442 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 FADS6Q8N9I5 356 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NAXEQ8NCW5 288 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OR4C3Q8NH37 302 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 RNF138Q8WVD3 245 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SMPDL3BQ92485 455 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CDS1Q92903 461 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 COQ8BQ96D53 544 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 GIMAP5Q96F15 307 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 C14orf79Q96F83 325 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TM9SF2Q99805 663 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PIGQQ9BRB3 760 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 BTBD2Q9BX70 525 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ACTRT3Q9BYD9 372 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PIGUQ9H490 435 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 HHATLQ9HCP6 504 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 UBQLN4Q9NRR5 601 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 THAP1Q9NVV9 213 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms