RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf49Q96BT1 292 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 HHATLQ9HCP6 504 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 OR51T1Q8NGJ9 327 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 MALSU1Q96EH3 234 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM68Q96MH6 324 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 KCMF1Q9P0J7 381 aa20.13■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 AGAP4Q96P64 663 aa20.13■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 GTF2H4Q92759 462 aa20.13■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 RAD1O60671 282 aa20.13■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa20.13■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.12■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 RAB5CP51148 216 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 C19orf12Q9NSK7 152 aa20.11■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1211LQ6NV74 962 aa20.11■□□□□ 0.81
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PTPRM-211ENST00000580170 SYT3Q9BQG1 590 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 SAP130Q9H0E3 1048 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 RARRES3Q9UL19 164 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 FUT1P19526 365 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRM-211ENST00000580170 RABIFP47224 123 aa20.1■□□□□ 0.81
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